図 1
※ GeneChip® Mapping 250K Sty Assay Kit は2010年12月22日をもって販売終了となりました。
Affymetrix GeneChip® Mapping 500K Assayは、GeneChip® Mapping 500K Set と共に使用するもので、ゲノムDNAのサンプルで500,000以上の一塩基多型（SNP）を検出できるようにデザインされています。 Mapping 500K Setは、2つのアレイおよび2つのアッセイキットから成ります。 それぞれのアレイにはそれぞれに対応するアッセイキットを使用します。 プロトコルは、アレイ当たりゲノムDNA 250 ngから始めます。それぞれアレイにつき約250,000のSNPに対するSNP遺伝子型コールが得られます。 このアッセイでは、最初にNsp IまたはSty I制限酵素を用いてゲノムDNAを消化し、次にDNAフラグメントにアダプターをライゲーションさせることにより、ヒトゲノムDNAの複雑さを最大で10分の1にまで低下させる戦略を利用しています。 さらに、特定のサイズ領域のフラグメントに対して最適化したPCR手順により、複雑さはさらに低下します。 この手順に続いて、PCR生成物（アンプリコン）を断片化し、末端標識し、GeneChipアレイにハイブリダイゼーションします。
さらなる詳細は GeneChip® Mapping 500K Assay Manual (pdf, 3.4 MB)をご覧ください。
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 900766 | GeneChip® Mapping 250K Nsp Assay Kit | Sufficient for 30 reactions |
| 900753 | GeneChip® Mapping 250K Nsp Assay Kit | Sufficient for 100 reactions |
| 900804 | GeneChip® Human Mapping 250K Nsp Adaptor | Sufficient for 100 reactions |
| 900806 | GeneChip® Human Mapping 250K PCR Primer 002 | Sufficient for 150 reactions |
Required Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| Affymetrix® GeneChip® Command Console® Software | Available Via Download | |
| Affymetrix® Genotyping Console™ Software | Available Via Download | |
| 00-0079 | GeneChip® Fluidics Station 400 or Fluidics Station 450/250 | |
| 800138 | GeneChip® Hybridization Oven | |
| 00-0186 | GeneChip® Scanner 3000 with high-resolution scanning patch |
Related Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 901153 | Genome-Wide Human SNP Array 6.0 |
