アフィメトリクスGeneChip® Human(パネル1&2)20K cSNP Kitは、単一アッセイでマルチプレックス処理された20,000のアミノ酸を変化させるSNPを検出する機能を持っています。 これには、10,000以上の遺伝子における機能的変化をコーディングする、検証済みのノンシノニマス(機能的変化を伴う)公開SNPが含まれています。 これにより、生物学的パスウェイと遺伝子機能にリンクしたノンシノニマス(機能的変化を伴う)SNPの直接検出で、仮説によるアソシエーション研究の実行が可能となります。Human(パネル1&2)20K cSNP Kitデータは、実証された分子反転プローブ(MIP)テクノロジーとアフィメトリクスのUniversal Tag Arrayを組み合わせて作製され、GeneChip® Scanner 3000 TG Systemでスキャンされます。
参考文献
Smyth D. J., et al. A genome-wide association study of nonsynonymous SNPs identifies a type 1 diabetes locus in the interferon-induced helicase (IFIH1) region. Nature Genetics 38(6):617-619 (2006).
Zanke B. W., et al. Genome-wide association scan identifies a colorectal cancer susceptibility locus on chromosome 8q24. Nature Genetics 39(8):pp989-94 (2007).
参考資料
Brochures
Data Sheets
GeneChip® Human Panel 1 & 2, 20K cSNP Kit (pdf, 181 KB)
White Papers
Targeted Genotyping Algorithm Enhancements for Release 1.5 (pdf, 21 KB)
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 900827 | GeneChip® Human (Panels 1 & 2) 20K cSNP Kit | Kit contains enough reagents to process a total of 24 assays (23 customer samples and one kit control) |
| 901185 | GeneChip® Universal 25K Tag Array 24 Pack | Each pack contains 24 arrays, enough to process one Human (Panels 1 & 2) 20K cSNP Kit |
Related Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 000534 | GeneChip® Human (Panels 1 & 2) 20K cSNP Service | For more information on pricing, minimum number of samples or a list of third-party service providers, please consult the Affymetrix Services Home Page. |
Assay Panel Files
Human (Panels 1 & 2) 20K cSNP Kit (zip, 481 KB)
Manuals
Targeted Genotyping Analysis (GTGS) User's Guide, includes TG protocol (pdf, 1.9 MB)
Targeted Genotyping System Site Preparation Guide (pdf, 892 KB)
Targeted Genotyping System User's Guide (pdf, 4.04 MB)
Quick Reference Cards
Targeted Genotyping Quick Reference Card, includes TG Protocol (zip, 1.62 MB)
User Bulletin, Affymetrix Targeted Genotyping System (pdf, 69 KB)
Material Safety Data Sheets
Human (Panels 1 and 2) 20K cSNP Kit (pdf, 96 KB)
Targeted Genotyping Wash Solution A (pdf, 26 KB)
Targeted Genotyping Wash Solution B (pdf, 26 KB)
Additional Support
Custom Panel Design Guide (zip, 143KB)
Custom Panel Design Request Form (zip, 12 KB)


