お知らせ:Exon 1.0STアレイとGene 1.0ST アレイ用アッセイ試薬として現在販売しております本製品は、2010年5月末日を以て販売を終了いたしました。また、これに伴い、本製品の構成品の一部や本製品をを含んだキットも同時に販売終了となりました。今後は、Ambion® WT Expression Kit をご利用くださいますようお願いいたします。
感度と特異性を最適にした、ExonとGene アレイのデザイン
確かで便利な完全試薬ソリューション
統合システムの重要部分として、特別にGeneChipR Exon とGene 1.0 ST Array用に、完全試薬キットを開発、検証、認定しました。 これらの試薬キットは利便性が向上し、さらに高品質な結果と整合性あるデータが得られます。
転写産物の全長に亘る、センス鎖DNAターゲットを生成
Whole Transcript (WT) Sense Labeling Assay は、ランダムプライミングを使い、in vitro転写ベースの線形増幅と、新しい断片化と末端標識アッセイを組み合わせることにより、ターゲット標識の強力なメソッドを提供します。WT Assayの2つの方法の主な違いを、下の表に示します。
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1µg 全RNA標識プロトコル
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100 ng 全RNA標識プロトコル
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|---|---|---|
| 開始試料の推奨量 | 1 µg 全RNA | 100 ng 全RNA |
| 投入量の受容範囲 | 1-2 µg* | 100-300 ng |
| 手順の違い | RiboMinus KitでrRNAの除去が必要 | rRNA低減は不要 |
| Exon STアレイ | 推奨 | 最適ではない |
| Gene STアレイ | 使用可能 | 推奨 |
* 2 µgの開始資料を用いた場合は、RiboMinus試薬を増やしてrRNA除去を効果的に行うことを推奨します。これを行わないと、特にエクソンレベルで、感度が若干低下することがあります。
開始試料として1 µgあるいは100 ngの全RNAを使用し、下の図に記載されているアッセイに従ってください。 100 ngの全RNAのプロトコルでは、最初のリボゾームRNA (rRNA) 除去のステップは行いません。 GeneChip® Exon 1.0 ST Array を使用して、遺伝子とエクソンの両方の発現レベルを高感度で解析したい場合は、rRNAの除去は必須となります。 これは、エクソンプローブセットには少数のプローブが含まれており、これらのプローブの選択が、プローブ選択領域のサイズに制限される場合があるからです。 その結果、最適なパフォーマンスを得るために、高感度のアッセイを使用することが必須となります。
一方、転写産物全体から選択した高品質のプローブが多数ある場合は遺伝子レベルの解析が有利になるため、rRNAの除去ステップを追加で行うメリットは少なくなります。 よって、GeneChip® Gene 1.0 ST Arrayでは、100 ng全RNA標識プロトコルが使用可能になります。 Gene 1.0 ST Arrayでの2つのプロトコルのパフォーマンスの詳細は、Whole Transcript Sense target Labeling Assayのパフォーマンスに関するホワイトペーパー (pdf, 801 KB) を参照してください。
*キットには含まれていないが、必要な試薬: RiboMinus™ Human/Mouse Transcriptome Isolation Kit(Invitrogen)。
**特定のバンドルキットでは不要。
詳細情報
- GeneChip® Exon Array Design
- Technical Note, Array Design for the Human Exon 1.0 ST Array (pdf, 348 KB)
- ホワイトペーパー, Human Gene 1.0 ST Array Performance (pdf, 620 KB)

現在、この製品に関する資料はございません。詳細については、supportjapan@affymetrix.comまでお問合せください。
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 900652 | GeneChip® WT Sense Target Labeling and Control Reagents | Sufficient for 30 reactions |
| 900654 | GeneChip® Human Exon 1.0 ST Array Starter Pack | Contains 30 arrays and 30 reactions of reagents |
| 900831 | GeneChip® Mouse Exon 1.0 ST Array Starter Pack | Contains 30 arrays and reagents sufficient for 30 reactions |
| 900848 | GeneChip® Rat Exon 1.0 ST Array Starter Pack | Contains 30 arrays and reagents sufficient for 30 reactions |
| 901147 | GeneChip® Human Gene 1.0 ST Arrays and Reagents, 10 Pack | Contains 10 arrays and reagents sufficient for 10 reactions |
| 901146 | GeneChip® Human Gene 1.0 ST Arrays and Reagents, 30 Pack | Contains 30 arrays and reagents sufficient for 30 reactions |
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| 900820 | GeneChip® Rat Exon 1.0 ST Array | |
| 901085 | GeneChip® Human Gene 1.0 ST Array | |
| 901168 | GeneChip® Mouse Gene 1.0 ST Array | |
| 901172 | GeneChip® Rat Gene 1.0 ST Array | |
| 900720 | GeneChip® Hybridization, Wash, and Stain Kit | |
| 00-0211 | GeneChip® Scanner 3000 7G with Workstation | |
| 00-0079 | GeneChip® Fluidics Station 450 |
FAQs
WT Sense Target Labeling Assay
Manuals
Whole Transcript (WT) Sense Target Labeling Assay (pdf, 1.18 MB)
Package Inserts
Eukaryotic Poly-A RNA Control Kit (pdf, 36 KB)
Hybridization Control Kit (pdf, 59 KB)
IVT cRNA Cleanup Kit (pdf, 270 KB)
Sample Cleanup Module (pdf, 55 KB)
WT cDNA Synthesis and Amplification Kit (pdf, 253 KB)
WT Terminal Labeling Kit (pdf, 259 KB)



