GeneChip^® Yeast Genome 2.0 Array

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GeneChip® Yeast Genome 2.0 Arrayは、酵母の中でも最も一般的に研究されている 2 つの種である、 Saccharomyces cerevisiae（出芽酵母）とSchizosaccharomyces pombe（分裂酵母）の両方に由来する転写産物を検出できるプローブセットを含んでいます。GeneChip® Yeast Genome 2.0 Arrayは、両種を広範にカバーしており、S. cerevisiaeの全5,845遺伝子中5,841遺伝子に対するおよそ5,744のプローブセットとS. pombeの全5,031 遺伝子に対する5,021のプローブセットを含みます。

5億年以上前に起きたS. cerevisiaeとS. pombeの進化の過程における分岐により、両種間の塩基配列は、全遺伝子に対するプローブセットを別々に選択できるほどはっきりと分岐しています。したがって、もっとも近傍にある交差種のオルソログでさえも別々に検出することができるのです。

これら2つの種を1枚のアレイで検出できるので、GeneChip® Yeast Genome 2.0 Array はS. cerevisiaeとS. pombe、両種を研究する方にフレキシブルでコストパフォーマンスの良いプラットフォームを提供します。

このアレイのデザインに使用された塩基配列情報は、GenBank®（2004年5月）やSanger Center（2004年6月）で公開されている S. cerevisiaeおよびS. pombe ゲノムのデータベースから選択されています。11 対のオリゴヌクレオチドプローブを用いて、GeneChip® Yeast Genome 2.0 Array上の各配列に対応する転写レベルを測定します。

Data Sheets

Yeast Genome 2.0 Array (pdf, 126 KB) - Japanese Version

Yeast Genome 2.0 Array (pdf, 304 KB)

Application Notes

Microarray Applications in Infectious Disease (pdf, 252 KB)

Part #	Description	Includes
900553	GeneChip® Yeast Genome 2.0 Array	Contains 2 arrays
900554	GeneChip® Yeast Genome 2.0 Array	Contains 6 arrays
900555	GeneChip® Yeast Genome 2.0 Array	Contains 30 arrays

Related Products

Part #	Description	Includes
	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 1.17 MB)

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

HT 3' IVT Express Kit (pdf 8.41 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Array Comparisons

Comparison Spreadsheets User's Guide (pdf, 82 KB)

Yeast S98 to Yeast 2.0, Best Match (zip, 80 KB)

Yeast S98 to Yeast 2.0, Complex Match (zip, 138 KB)

Yeast S98 to Yeast 2.0, Good Match (zip, 81 KB)

Yeast S98 to Yeast 2.0, No Match (zip, 6 KB)

Library Files

Yeast Genome 2.0 Array (zip, 7.4 MB)

Package Inserts

Yeast Genome 2.0 Array (pdf, 81 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

NetAffx Alignment Files

Yeast_2 Alignments To Genome, PSL Format (764 KB, 11/17/06)

Current NetAffx Annotation Files

Yeast_2 Annotations, CSV format, Release 32 (3.6 MB, 6/10/11)

Yeast_2 Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (17 MB, 6/9/11)

Yeast_2 BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (117 KB, 6/9/11)

Yeast_2 Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (1.9 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.