業界標準で証明された性能
GeneChip® PrimeView Human Gene Expression Array カートリッジは、十分にアノテーションが付いた定評あるコンテンツに重点を置いたプローブセットによる発現プロファイリングを実現しています。アレイのデザインに用いられる配列は、RefSeqバージョン 36、UniGene データベース219、GenBank® の完全長ヒトmRNAから選択しました。
PrimeView™ Human Gene Expression Array では、以下のことが可能になります。
- 1サンプルあたり36,000個の転写産物とバリアントの遺伝子発現を解析
- 各転写産物について複数の独立したプローブの測定値を用いることにより、正確かつ再現可能な遺伝子発現データを取得。
特長
- 優れた遺伝子発現の特異性と再現性。
- 転写産物ごとに多数の独立した測定値を用いることにより、信頼性の高い結果を提供。十分にアノテーションが付いた配列については1セットあたり11個のプローブ、残りの配列については1セットあたり9個のプローブを用います。
- アノテーションが付いたゲノムのカバー率は100%
- 最新のアノテーションによる業界最高の転写産物カバー率。RefSeqの十分にアノテーションが付いた遺伝子および転写産物すべてをカバーしています。
コンテンツプロフィール
- PrimeView Human Gene Expression Arrayは、36,000個以上の転写産物とバリアントをカバーする530,000個以上のプローブで構成されており、RefSeqまたはUniGeneアノテーションにより20,000個以上の遺伝子をマッピングできます。
- デザインに用いられたESTおよびmRNA配列は、クラスター化およびアッセンブルされており、選択的スプライスフォームを示すコンセンサスシークエンスを作製ｓｈちえいます。次に各アッセンブリを解析して、転写の方向性および選択的3'末端を決定しました。
- コンテンツは、RefSeq v36 の十分なアノテーションが付いた遺伝子および転写産物をすべてカバーするように選択されています。また、同じクラスターに属する利用可能なすべてのESTおよびmRNAを活用することにより、それらの十分にアノテーションが付いた遺伝子の選択的3'末端を厳密に検出できるようになっています。
- 1,000個以上のプローブセットは、UniGeneに公式の遺伝子シンボルを持たない転写産物を示しますが、これらは予測されるRefSeq配列およびUniGene クラスターに基づいており、実際の転写の良好なエビデンスが認められています。
本製品は試験研究用ですので、診断の目的には使用できません。
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 901837 | GeneChip® PrimeView™ Human Gene Expression Array | contains 10 arrays |
| 901838 | GeneChip® PrimeView™ Human Gene Expression Array | contains 30 arrays |
| 901839 | GeneChip® PrimeView™ Human Gene Expression Array and 3' IVT Express Kit Bundle | sufficient for 10 reactions |
| 901840 | GeneChip® PrimeView™ Human Gene Expression Array and 3' IVT Express Kit Bundle | sufficient for 30 reactions |
Required Products
Related Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| GeneChip HT HG-U133+ PM Array Plate | ||
| GeneChip Human Gene 1.0 ST Array | ||
| GeneChip Human Exon 1.0 ST Array | ||
| Human Gene 1.1 ST Array Plate |
Library Files
PrimeView™ Human Gene Expression Array (pdf, 15.2 MB)
Package Inserts
PrimeView™ Human Gene Expression Array (pdf, 128 KB)
Alignment, Annotation, and Sequence Files
Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files
Current NetAffx Annotation Files
PrimeView Annotations, CSV format, Release 32 (22 MB, 8/25/11)
PrimeView Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (101 MB, 8/25/11)
PrimeView BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (2.3 KB, 8/25/11)
PrimeView Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (9.9 MB, 8/25/11)
Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.
Sequence Files
PrimeView Consensus Sequences FASTA Format (46 MB, 8/25/11)
PrimeView Control Sequences FASTA Format (34 KB, 8/25/11)
PrimeView Probe Sequences, tabular format (8.5 MB, 8/25/11)
PrimeView Target Sequences FASTA Format (10 MB, 8/25/11)
