Affymetrix® Mouse Diversity Genotyping Array

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Affymetrix® Mouse Diversity Genotyping Array をご利用いただくと、幅広いマウス系統とその交雑系の正確な特徴づけを行うことができ、疾患モデルマウスにみられる遺伝子変異を明らかにすることができます。

他社製品の120 倍を超える数の一塩基多型（SNP）を搭載し、平均 SNP 間距離 4.3ｋｂの Mouse Diversity Genotyping Array は、これまでに公開されたどのマウス SNP アレイよりも高密度かつ広分布を実現しています。

Mouse Diversity Genotyping Array の特長

最高レベルのジェノタイピング性能を誇るマウスジェノタイピングアレイ
- 623,000 以上の一塩基多型（SNP）を調査
従来の100 倍以上のリンケージマッピング性能
- マッピング分解能 4.3 kb
コピー数プローブを備えた唯一のアレイ
- 機能エレメントと、セグメント重複の存在が既に知られている領域に的を絞り、916,000 以上の非多型領域を調査
高性能指標（標準的な近交系実験用12系統とそのF1交雑系の場合）
- コール率 98.6%
- 再現性 99.9%
- 一致率 99.5%
- エラー率 0.5% 未満
実験用マウスに対する最大のカバー率
- 標準的な近交系12系統と野生由来および野生型７系統に由来するSNPプローブを搭載
最も柔軟性の高いアプローチ
- 1枚のアレイで標準的な近交系と野生由来系統の両方に対応し、マウスのどのような遺伝学的研究にも適用可能
1 ジェノタイプあたり最も低コスト
- SNP1個あたりの経費はごくわずか

品質管理およびジェノタイピングのコール手法に関する解説のダウンロードについては、Affymetrix Power Tools をご参照ください。ATP はダウンロードしてご利用いただけます（ジェノタイピングコールに改良版 BRLMM-P アルゴリズムを実行する場合にご利用ください)。

アレイのデザインに関する詳細は、A customized and versatile high-density genotyping array for the mouse (Yang H., et al., Nature Methods, 2009) に掲載されておりますので、ぜひご覧ください。

本製品は研究用です。診断目的にはご利用いただけません。

Data Sheets

Affymetrix® Mouse Diversity Genotyping Array (pdf 1.0 MB)

Part #	Description	Includes
901615	Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array	Contains 30 arrays (minimum initial order of 60 arrays; 30-array minimum for subsequent orders)

Required Products

Part #	Description	Includes
901013	Affymetrix® Genome-Wide Human SNP Nsp/Sty Assay	Sufficient for 30 reactions
901152	Affymetrix® Genome-Wide Human SNP Nsp/Sty Assay	Sufficient for 50 reactions
901015	Affymetrix® Genome-Wide Human SNP Nsp/Sty Assay	Sufficient for 100 reactions
00-0079	GeneChip® Fluidics Station 450
00-0331	GeneChip® Hybridization Oven
00-0211	GeneChip® Scanner 3000 7G

FAQs

Mouse Diversity Genotyping Array (pdf, 114 KB)

Manuals

Genome-Wide Human SNP Nsp/Sty 6.0 User Guide (pdf, 2.13 MB)

Quick Reference Cards

SNP 6.0 Protocol for 48 Samples (pdf, 484 KB)

SNP 6.0 Protocol for 96 Samples (pdf, 503 KB)

Sample Data

Mouse Diversity Genotyping Array, Sample Data 1 of 5 (zip, 898 MB)

Mouse Diversity Genotyping Array, Sample Data 2 of 5 (zip, 897 MB)

Mouse Diversity Genotyping Array, Sample Data 3 of 5 (zip, 912 MB)

Mouse Diversity Genotyping Array, Sample Data 4 of 5 (zip, 902 MB)

Mouse Diversity Genotyping Array, Sample Data 5 of 5 (zip, 861 MB)

Material Safety Data Sheets

Genome-Wide Human SNP 5.0/6.0 Assay Kits, with Reference DNA (zip, 333 KB)

MSDS, SNP 6.0 Core Reagent Kit (zip, 476 KB)

Library Files

Mouse Diversity Array, AGCC Library Files (zip, 80.1 MB)

Mouse Diversity Array, Analysis Files (zip, 112 MB)

Mouse Diversity Array, Annotation Converter (zip, 4 KB)

Package Inserts

Genome-Wide Human SNP Nsp/Sty Assay Kit 5.0/6.0 (pdf, 76 KB)

Mouse Diversity Genotyping Array (pdf, 72 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

MOUSEDIVm520650 Annotations, CSV format, Release 32 (39 MB, 10/25/11)

MOUSEDIVm520650 Annotations, SQLite Format, Release 32 (64 MB, 10/25/11)

MOUSEDIVm520650 CN Annotations, CSV format, Release 32 (35 MB, 10/25/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.