GeneChip^® Medicago Genome Array

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GeneChip® Medicago Genome Arrayは、タルウマゴヤシ（Medicago truncatula）、ムラサキウマゴヤシ（Medicago sativa）とその共生生物であるアルファルファ根粒菌（Sinorhizobium meliloti）の遺伝子発現をモニターするために特別にデザインされたアレイです。本アレイは、マメ科植物のゲノムや窒素固定細菌と植物との共生関係を研究する農学研究者にとって、特に有用です。

本アレイの塩基配列情報は、TIGRのタルウマゴヤシ遺伝子インデックス（The Institute for Genomic Research, 2005年1月）やInternational Medicago Genome Annotation Group（IMGAG）の遺伝子予測、TIGRが公開するアルファルファ根粒菌ゲノムの遺伝子予測、ムラサキウマゴヤシのEST情報などのデータソースから選択されています。アレイには、61,200個以上のプローブセット（タルウマゴヤシのEST／mRNAおよび葉緑体遺伝子に基づくプローブセット32,167個、タルウマゴヤシのIMGAGおよびフェーズ2／3のBAC予測に基づくプローブセット18,733個、ムラサキウマゴヤシのEST／mRNAに基づくプローブセット1,896個、アルファルファ根粒菌の遺伝子予測に基づくプローブセット8,305個）が含まれています。

解析に必要な機器およびソフトウェア

* GeneArray^® 2500 Scannerをお持ちのお客様は、GCS3000 7Gへのアップグレードが必要となります。別途ご相談ください。

Data Sheets

Medicago Genome Array (pdf, 504 KB)

Part #	Description	Includes
900734	GeneChip® Medicago Genome Array	Contains 2 arrays
900735	GeneChip® Medicago Genome Array	Contains 6 arrays
900736	GeneChip® Medicago Genome Array	Contains 30 arrays

Related Products

Part #	Description	Includes
	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 1.17 MB)

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

HT 3' IVT Express Kit (pdf 8.41 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Library Files

Medicago Genome Array (zip, 31 MB)

Package Inserts

Medicago Genome Array (pdf, 492 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

Medicago Annotations, CSV format, Release 32 (3.4 MB, 6/9/11)

Medicago Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (37 MB, 6/9/11)

Medicago BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (3.2 KB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.