※ この製品は、2011年6月以降、在庫がなくなり次第、カタログ製品から受注生産品へ移行します。詳しくはこちらをご覧ください。
タンパク質/DNA相互作用をクロマチン免疫沈降(ChIP)法で研究するための、最も包括的な全ゲノムアレイセット。
- 35 bpという高密度なプローブ間隔が、タンパク質/DNA相互作用の正確な測定を可能とします。
- 25 merのプローブによって、極めて特異的なハイブリダイゼーション結果が得られます。
アレイプロフィール
GeneChip® Human Tiling 2.0R Array Set は、クロマチン免疫沈降(ChIP)法用にデザインされました。この7枚のアレイからなるセットには、ヒトゲノムを調べるためオリゴヌクレオチドプローブが約4,500万個搭載されています。また、本セットの各アレイには、特定のゲノム領域を調べるためのパーフェクトマッチプローブが650万以上含まれています。
Human Tiling 2.0R Array Set のデザインに使われている配列は、NCBIヒトゲノムアセンブリ(Build34)から選択されました。なお、反復配列はRepeatMaskerによって取り除かれています。Human Tiling 2.0R Array Setには7枚のアレイからなる全ゲノムセット(製品番号900772)が用意されているほか、セットに含まれるアレイは個別にも販売しております。なお、GeneChip® Human Promoter 1.0R Array(製品番号900776)はプロモーター領域内のタンパク質/DNA相互作用を解析するために、特別にHuman Tiling 2.0R Tiling Array Set の一部を選択した製品です。
各プローブには、隣接するオリゴ(25 mer)の中央の位置から測定して平均35 bpの分解能でタイリングされており、プローブ間には約10 bpのギャップが残されています。なお、オリゴヌクレオチドプローブは対応する各配列に相補的に in situ で合成されています。
解析に必要な機器およびソフトウェア
詳細についてはdata sheet (7.52MB)をご参照ください。.
Data Sheets
Human Tiling Arrays (pdf, 260 KB)
Archived Presentations
Scientific Forum, 1st European ChIP-on-chip
Webinar, Six-part ChIP-on-chip Symposia Series
Application Notes
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 900772 | GeneChip® Human Tiling 2.0R Array Set | Complete A-G genome set 1 7-Array set |
Related Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| Integrated Genome Browser (IGB) | Available Via Download | |
| Tiling Analysis Software (TAS) | Available Via Download | |
| 900301 | Control Oligo B2, 3nM | Sufficient for 30 samples |
| 900812 | GeneChip® WT Double-Stranded DNA Terminal Labeling Kit | Sufficient for 30 reactions |
Manuals
Chromatin Immunoprecipitation Assay Protocol (pdf, 679 KB)
Tutorial
Material Safety Data Sheets
WT Double-Stranded cDNA Synthesis Kit (zip, 166 KB)
Library Files
GeneChip Tiling Arrays - Data Analysis Library File Updates
Human Genome 2.0 Tiling Array Set NCBIv36 bed file
Human Genome 2.0 Tiling Array Set NCBIv36 BPMAP files
Human Genome 2.0 Tiling Array Set NCBIv36 probe bed files
Human Tiling 2.0R Array Set (zip, 1 GB)
Package Inserts
Human Tiling 2.0R Array Set (pdf, 489 KB)


