GeneChip® HT RG-230 PM Array Plate

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HT Array Plate
HT Array Plate
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業界標準により証明された性能

GeneChip® HT RG-230 PM Array Plate は、GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Array*と同じ業界標準のコンテンツを利用して、同時に16,24または96サンプルのハイスループット発現プロファイリングを可能にしています。

HT RG-230 PM Array Plate を利用すれば

  • アレイ1枚で、既知の28,000を超えるラット遺伝子からの、30,000を超える転写産物とバリアントの遺伝子発現を測定できます。
  • それぞれの転写産物について、独立した複数のデータを測定することで、正確で再現性のあるデータを得ることができます。

RMA signal correlations (left to right): Rat Focus Array Plates versus HT RG-230 PM Array Plates (RG PM); HT RG-230 PM Array Plates versus HT RG-230 PM Array Plates; HT MG-430 A Plates (430A) versus HT MG-430 PM Array Plates (MG PM); and HT MG-430 PM Array Plates versus HT MG-430 PM Array Plates.
図 1
RMA signal correlations (left to right): Rat Focus Array Plates versus HT RG-230 PM Array Plates (RG PM); HT RG-230 PM Array Plates versus HT RG-230 PM Array Plates; HT MG-430 A Plates (430A) versus HT MG-430 PM Array Plates (MG PM); and HT MG-430 PM Array Plates versus HT MG-430 PM Array Plates.

主な特長

  • 同時並行処理により高い生産性と効率化を実現
    • 1枚アレイプレートでの 16,24 または 96 サンプルを処理
  • カートリッジタイプのRat Genome 230 2.0 Array に匹敵する業界最高の性能とコンテンツ
    • 従来のデザインとの高い相関性を持つシグナル
  • 転写産物ごとに独立した複数のデータを測定することで信頼性の高い結果を取得
    • 単一プローブ測定に比べより多くの配列を解析
  • 便利なパッケージ
    • 16,24 および96 アレイプレートのみも販売 
    • ハイスループット用のプレートと試薬のバンドル製品

コンテンツプロフィール

アレイのデザインに用いた配列は、GenBank®, dbEST および RefSeqから選択したものです。配列クラスターは、Unigene Gene データベース (Build 99, 2002年6月) から作製し、公開されているBaylor College of Medicine Human Genome Sequencing Centerのラットゲノムのドラフト配列(2002年6月)との解析や比較を経て改良されています。

* HT RG-230 PM Array Plate には、カートリッジデザインからパーフェクトマッチ(PM)プローブのみを残しています。ミスマッチ(MM)プローブは取り除かれています。

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Part # Description Includes
901435 GeneChip® HT RG-230 PM 16-Array Plate Contains 1 16-array plate and necessary hybridization, wash and scan trays.
901259 GeneChip® HT RG-230 PM 24-Array Plate Contains 1 24-array plate and necessary hybridization, wash and scan trays.
901260 GeneChip® HT RG-230 PM 96-Array Plate Contains 1 96-array plate and necessary hybridization, wash and scan trays.

FAQs

HT PM Plate Arrays

Manuals

Expression Analysis Technical Manual For HT Array Plates Using the GeneChip® Array Station (pdf, 7.4 MB)

Quick Reference Cards

QC Metrics for Human, Mouse and Rat HT PM Array Plates (pdf, 111 KB)

Library Files

HT RG-230 PM Array Plate and Array Strip Library File (zip, 8.21 MB)

HT_Rat230_PM Expression Console ™ Software Report Controls File

Package Inserts

HT RG-230 PM Array Plate (pdf, 668 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 32 (9.4 MB, 6/9/11)

HT_Rat230_PM Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (31 MB, 6/9/11)

HT_Rat230_PM BLASTP annotations, CSV Format, Release 31 (60 KB, 8/11/10)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.

Sequence Files

HT_Rat230_PM Consensus Sequences FASTA Format (9.3 MB, 1/6/09)

HT_Rat230_PM Probe Sequences, FASTA format (6.4 MB, 3/11/09)

HT_Rat230_PM Probe Sequences, tabular format (5.7 MB, 3/11/09)

HT_Rat230_PM Target Sequences FASTA Format (5.8 MB, 1/6/09)

Archived NetAffx Annotation Files

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 27 (8.6 MB, 2/26/09)

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 27 (8.6 MB, 11/30/08)

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 28 (8.5 MB, 3/12/09)

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 29 (8.8 MB, 7/1/09)

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 30 (9.1 MB, 11/15/09)

HT_Rat230_PM Annotations, CSV format, Release 31 (9.4 MB, 8/11/10)

HT_Rat230_PM Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 28 (29 MB, 3/12/09)

HT_Rat230_PM Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 29 (30 MB, 7/1/09)

HT_Rat230_PM Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 30 (30 MB, 11/15/09)

HT_Rat230_PM Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 31 (31 MB, 8/11/10)

HT_Rat230_PM BLASTP annotations, CSV Format, Release 28 (1.7 KB, 3/4/09)

HT_Rat230_PM BLASTP annotations, CSV Format, Release 29 (54 KB, 7/1/09)

HT_Rat230_PM BLASTP annotations, CSV Format, Release 30 (54 KB, 11/16/09)

Archived Sequence Files

HT_Rat230_PM Probe Sequences, FASTA format (6.1 MB, 7/16/08)

HT_Rat230_PM Probe Sequences, tabular format (5.5 MB, 7/16/08)

Additional Support

Installing GeneTitan Scripts for 16 peg 3' IVT HT Array Plates (zip, 41 KB)

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