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GeneChip^® HT Mouse Genome
430 Array Plate Set

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HT Array Plate

GeneChip® HT Mouse Genome 430 Array Plate Setは、一度に最大96のマウスサンプルの全ゲノム発現解析が可能で、大規模研究を行うことができます。このセットは430Aと430Bプレートから成り、34,000を超える既知遺伝子とUniGeneクラスターの発現レベルを測定します。

プレート当たり最大96のAまたはBアレイを処理することができます。各アレイは、MG-430AおよびMG-430B Arrayカートリッジフォーマットと同じプローブセットが含まれます。

サンプル当たり34,000以上の既知遺伝子とUniGeneクラスターを含む、39,000以上の転写産物およびバリアントの遺伝子発現を測定します。
45,000を超えるプローブセットと100万のオリゴヌクレオチドで、各転写産物を独立した複数の測定することにより、正確で再現性の高いデータが得られます。

研究者は次の目的で大規模研究にHTシステムを採用しています：

解析の労力コスト削減と時間短縮
研究所内や複数の研究所間での標準化が向上
複数のマイクロアレイを並行進行する管理が簡単

アレイプレートデザイン

AおよびBプレートはこれに最大96の個別マイクロアレイが付属しています。このプレートは通常の96ウェルプレートフォーマットでリキットハンドリング装置が使用できる空間設計になっています。この仕様は大規模研究のニーズに対応した設計で、複数のマイクロアレイを並行進行する際の管理を大幅に簡略化し、労力コストが削減でき、研究所内や複数の研究所間での標準化を向上させることができます。各プレートについて、次の2つの仕様が提供されています。

24アレイプレート – 24HT MG-430AまたはHT MG-430Bマイクロアレイは、24アレイがプレート1枚に配置されており、同時処理・解析ができます。
96アレイプレート – 96HT MG-430AまたはHT MG-430Bマイクロアレイは、96アレイがプレート1枚に配置されています。

コンテンツプロフィール

プローブセットは、GenBank®、dbEST、RefSeq由来する配列から選択されています。配列クラスターはUniGeneデータベース（ビルド107、2002年6月）から作成され、ホワイトヘッドゲノム研究センター（MSCG、2002年4月）のマウスゲノムの公開ドラフトアセンブリと比較解析することによってさらに正確さを増しています。

各配列を補うオリゴヌクレオチドプローブは、アレイ上でin situ合成されます。 GeneChip® HT Mouse Genome 430 Array Plate Setの各配列の転写レベルの測定には、11組のオリゴヌクレオチドプローブ（完全マッチとミスマッチのプローブを含む）が使用されます。

解析に必要な試薬、機器、ソフトウェア

GeneChip® HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit
GeneChip® Array Station
GeneChip® HT Array Plate Scanner
次のソフトウェアから成るGeneChip® HT Software Suite：
- GeneChip® Operating Software (GCOS) v1.2 or higher
- HT Image Reader
- HT Data Transfer Tool

詳しくは data sheet (pdf, 245 KB) を参照してください。

Data Sheets

HT Array Replacement Guideline (pdf, 179 KB)

Mouse Genome 430 Arrays (pdf, 245 KB)

White Papers

HT and Cartridge IVT Expression Arrays (pdf, 601 KB)

Performance Evaluation of the GeneChip® HT Array Plate Scanner (pdf, 1.96MB)

GeneChip^® HT Mouse Genome 430 Plates with Reagents

Part #	Description	Includes
901045	GeneChip® HT Mouse Genome 430A 96-Array Plate	Contains 1 HT Mouse 430A 96-Array Plate
901044	GeneChip® HT Mouse Genome 430A 24-Array Plates	Contains 4 HT Mouse 430A 24-Array Plates
901051	GeneChip® HT Mouse Genome 430A 96-Array Plate with Reagents	Contains 1 HT Mouse 430A 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit, 96 Reactions
901050	GeneChip® HT Mouse Genome 430A 24-Array Plates with Reagents	Contains 4 HT Mouse 430A 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit, 96 Reactions
901047	GeneChip® HT Mouse Genome 430B 96-Array Plate	Contains 1 HT Mouse 430B 96-Array Plate
901046	GeneChip® HT Mouse Genome 430B 24-Array Plates	Contains 4 HT Mouse 430B 24-Array Plates
901053	GeneChip® HT Mouse Genome 430B 96-Array Plate with Reagents	Contains 1 HT Mouse 430B 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit, 96 Reactions
901052	GeneChip® HT Mouse Genome 430B 24-Array Plates with Reagents	Contains 4 HT Mouse 430B 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit, 96 Reactions
900800	GeneChip® HT Mouse Genome 24-Array Plate Set	Contains 4 HT Mouse 430A 24-Array Plates Contains 4 HT Mouse 430B 24-Array Plates
900803	GeneChip® HT Mouse Genome 96-Array Plate Set	Contains 1 HT Mouse 430A 96-Array Plates Contains 1 HT Mouse 430B 96-Array Plates
900844	GeneChip® HT Mouse Genome 24-Array Plate Set with Reagents	Contains 4 HT Mouse 430A 24-Array Plates Contains 4 HT Mouse 430B 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit
900847	GeneChip® HT Mouse Genome 96-Array Plate Set with Reagents	Contains 1 HT Mouse 430A 96-Array Plate Contains 1 HT Mouse 430B 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit

Required Products

Part #	Description	Includes
900686	GeneChip® HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit	Sufficient for 96 reactions
00-0162 00-0235	GeneChip® Array Station	See Product Page
00-0332	GeneChip® HT Array Plate Scanner
	GeneChip® HT Software Suite	GeneChip® Operating Software (GCOS) v1.2 or higher HT Image Reader HT Data Transfer Tool

Related Products

Part #	Description	Includes
	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Library Files

HT Mouse Genome 430 (zip, 25 MB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

HT_MG-430A Annotations, CSV format, Release 32 (10 MB, 6/9/11)

HT_MG-430B Annotations, CSV format, Release 32 (6.5 MB, 6/9/11)

HT_MG-430A Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (48 MB, 6/9/11)

HT_MG-430B Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (30 MB, 6/9/11)

HT_MG-430A BLASTP annotations, CSV Format, Release 31 (494 B, 8/11/10)

HT_MG-430B BLASTP annotations, CSV Format, Release 31 (904 B, 8/11/10)

HT_MG-430A Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (6.3 MB, 6/9/11)

HT_MG-430B Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (3.4 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.