Research Solutions Affymetrix US website

Ordering Information

GeneChip^® HT Human Genome U133 Array Plate Set

Email | Print

HT Array Plate

GeneChip® HT Human Genome U133 Array Plate Setは、一度に最大96サンプルの全ゲノム発現解析が可能で、大規模研究を行うことができます。このセットはU133AとU133Bプレートから成り、33,000を超える既知遺伝子とUniGeneクラスターの発現レベルを測定します。

これにより、プレート当たり最大96のAまたはBアレイを処理することができます。各アレイには、HG-U133AアレイおよびHG-U133Bアレイカートリッジフォーマットと同じプローブセットが採用されています。

サンプル当たり33,000以上の既知遺伝子とUniGeneクラスターを含む約39,000の転写産物およびバリアントの遺伝子発現を測定します。
45,000を超えるプローブセット、100万のオリゴヌクレオチドによりで、各転写産物を独立した複数の測定することにより、正確で再現性の高いデータが得られます。

研究者は次の目的で大規模研究にHTシステムを採用しています：

最大96サンプルを一度に解析。
研究所内や複数の研究所間での標準化が向上。
複数のマイクロアレイを並行進行する管理が簡単。

アレイプレートデザイン

AおよびBプレートは最大96の個別マイクロアレイが付属しています。このプレートは通常の96ウェルプレートフォーマットでリキットハンドリング装置が使用できる空間設計になっています。この仕様は大規模研究のニーズに対応した設計で、複数のマイクロアレイを並行進行する際の管理を大幅に簡略化し、労力コストが削減でき、研究所内や複数の研究所間での標準化を向上させることができます。各プレートについて、次の2つの仕様が提供されています。

24アレイプレート – 24HT HG-U133AまたはHT HG-U133Bマイクロアレイは、24アレイがプレート1枚に配置されており、同時処理・解析できます。
96アレイプレート – 96HT HG-U133AまたはHT HG-U133Bマイクロアレイは、96アレイがプレート1枚に配置されています。

コンテンツプロフィール

アレイの設計に使用されている配列は、GenBank®、dbEST、RefSeqから選択されています。配列クラスターはUniGeneデータベース（ビルド133、2001年4月20日）から作成され、他の数多くの公開データベース（ワシントン大学ESTトレースレポジトリやカリフォルニア大学サンタクルーズ校ゴールデンパスヒューマンゲノムデータベース（2001年4月公開）など）と比較解析することによってさらに正確さを増しています。

各配列を補うオリゴヌクレオチドプローブは、アレイ上でin situ合成されます。 GeneChip® HT Human Genome U133 Array Plate Setの各配列の転写レベルの測定には、11組のオリゴヌクレオチドプローブが使用されます。

Data Sheets

HT Array Replacement Guideline (pdf, 179 KB)

Human Genome U133 Arrays (pdf, 1.76 MB)

White Papers

HT and Cartridge IVT Expression Arrays (pdf, 601 KB)

Performance Evaluation of the GeneChip® HT Array Plate Scanner (pdf, 1.96MB)

GeneChip^® HT Human Genome U133 Array Plates

Part #	Description	Includes
900750	GeneChip® HT Human Genome U133A 24-Array Plate	Contains 4 HT HG-U133A 24-Array Plates
900751	GeneChip® HT Human Genome U133A 96-Array Plate	Contains 1 HT HG-U133A 96-Array Plates
901042	GeneChip® HT Human Genome U133B 24-Array Plate	Contains 4 HT HG-U133B 24-Array Plates
901043	GeneChip® HT Human Genome U133B 96-Array Plate	Contains 1 HT HG-U133B 96-Array Plates
901078	GeneChip® HT Human Genome U133 24-Array Plate Set	Contains 4 HT HG-U133A 24-Array Plates Contains 4 HT HG-U133B 24-Array Plates
901077	GeneChip® HT Human Genome U133 96-Array Plate Set	Contains 1 HT HG-U133A 96-Array Plate Contains 1 HT HG-U133B 96-Array Plate

GeneChip^® HT Human Genome U133 Array Plates with Reagents

Part #	Description	Includes
900832	GeneChip® HT Human Genome U133A 24-Array Plate with Reagents *	Contains 4 HT HG-U133A 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit, 96 Reactions
900833	GeneChip® HT Human Genome U133A 96-Array Plate with Reagents*	Contains 1 HT HG-U133A 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit, 96 Reactions
901048	GeneChip® HT Human Genome U133B 24-Array Plate with Reagents*	Contains 4 HT HG-U133B 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit, 96 Reactions
901049	GeneChip® HT Human Genome U133B 96-Array Plate with Reagents*	Contains 1 HT HG-U133B 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit, 96 Reactions
901080	GeneChip® HT Human Genome U133 24-Array Plate Set with Reagents*	Contains 4 HT HG-U133A 24-Array Plates Contains 4 HT HG-U133B 24-Array Plates Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit
901079	GeneChip® HT Human Genome U133 96-Array Plate Set with Reagents*	Contains 1 HT HG-U133A 96-Array Plate Contains 1 HT HG-U133B 96-Array Plate Contains 1 HT One-Cycle Target Labeling and Control Kit
	* All trays necessary for Array Plate processing are packaged with HT Array Plates listed above.

Required Products

Part #	Description	Includes
900686	GeneChip® HT One-Cycle Target Labeling and Controls Kit	Sufficient for 96 reactions
00-0162 00-0235	GeneChip® Array Station	See Product Page
00-0332	GeneChip® HT Array Plate Scanner
	GeneChip® Operating Software	Available Via Download
	HT Image Reader
	HT Data Transfer Tool

Related Products

Part #	Description	Includes
	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

Expression Analysis Technical Manual For HT Array Plates Using the GeneChip® Array Station (pdf, 7.4 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Library Files

HT Human Genome U133A (zip, 13 MB)

HT Human Genome U133B (zip, 13 MB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

HT_HG-U133A Annotations, CSV format, Release 32 (11 MB, 6/9/11)

HT_HG-U133B Annotations, CSV format, Release 32 (8.1 MB, 6/9/11)

HT_HG-U133A Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (46 MB, 6/9/11)

HT_HG-U133B Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (26 MB, 6/9/11)

HT_HG-U133A BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (3.9 KB, 6/9/11)

HT_HG-U133B BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (6.0 KB, 6/9/11)

HT_HG-U133A Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (4.7 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.