Afftymetrix® PrimeView™ Human Gene Expression Array Plate

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業界標準に裏付けられた高性能

Affymetrix® PrimeView^TM Human Gene Expression Array Plate は、確立され、十分なアノテーションが付けられているコンテンツに重点をおいたプローブセットを採用し、一度に96サンプルのハイスループットの発現プロファイリングを可能にします。本アレイのデザインに用いられているシークエンスは、UniGene データベース 219 （2009年3月30日ビルド）、RefSeq version 36 (2009年7月13日), および GenBank® (2009年5月12日ダウンロード) の完全長ヒトmRNAから選択されています。

PrimeView^TM Human Gene Expression Array Plate でできること

サンプル当たり36,000以上の転写産物および変異体の遺伝子発現の測定
各転写産物に対し複数の独立した測定値を用いることによる、正確で再現性のある遺伝子発現データの取得

主な特長

並行処理により高い生産性と効率性
- 単一アレイプレートでの96サンプル処理
正確性と再現性に優れた遺伝子発現測定
- 結果の信頼性を高める、転写産物ごとに複数の独立した測定値－十分にアノテーションが付されたシークエンスについてはセット当たり11プローブ、他はセットあたり9プローブ
アノテーションが付いたゲノムを完全にカバー
- 業界で最高の転写産物カバー率と、最新のアノテーション－十分にアノテーションが付されたRefSeqの遺伝子と転写産物を全てカバー

コンテンツの概要

PrimeView^TM Human Gene Expression Array Plate は、UniGene あるいは RefSeq アノテーションによってマッピングされた20,000を超える遺伝子に対応する（を検出する）530,000以上のプローブを使用しており、36,000以上の転写産物と変異体をカバーしています。
本製品のデザインに使用されている EST およびｍRNA シークエンスは、クラスタ化後アセンブルされ選択的スプライスフォームに対応するコンセンサスシークエンスが生成されました。各アセンブリは、その方向性と選択的3'末端のエビデンスが解析されています。.
コンテンツは、十分にアノテーションが付されている RefSeq v36 (NM_ accession type) の遺伝子と転写産物を全てカバーするように、さらに同じクラスターに入る全てのESTおよびmRNAに関する入手可能なエビデンスを活用することによって、これら十分にアノテーションが付された遺伝子について、選択的3'末端も正確に検出できるように選ばれています。
1,000 を超えるプローブセットは、UniGene に正式な遺伝子シンボルを持たない転写産物に対応しますが、これらは実際の転写の十分な証拠から、予測のRefSeq配列とUniGeneクラスタに基づいています。

本製品は試験研究用です。診断の目的には使用できません。

現在、この製品に関する資料はございません。詳細については、supportjapan@affymetrix.comまでお問合せください。

Part #	Description	Includes
901595	Affymetrix® PrimeView™ Human Gene Expression Array Plate 96-Array Plate and trays	Contains 1 96-array plate

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901530	GeneTitan Hybridization, Wash, and Stain Kit for 3' IVT Arrays	96 reactions

Sample Data

MAQC A and B sample data (zip, 13.5 MB)

Array Comparisons

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Best Match (zip, 1 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Complex Match (zip, 3.2 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Good Match (zip, 1.3 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, No Match (zip, 6 KB)

Library Files

HG-U219 Expression Console ™ Software Report Controls File

Package Inserts

Human Genome U219 Array Plate (pdf, 548 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

HG-U219 Annotations, CSV format, Release 32 (22 MB, 6/10/11)

HG-U219 Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (100 MB, 6/9/11)

HG-U219 BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (2.2 KB, 6/9/11)

HG-U219 Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (9.5 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.