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GeneChip^® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

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Human Genome U133 Plus 2.0 Arrayは、はじめての包括的ヒトゲノム発現解析用アレイです。

１枚のアレイで合計47,000以上の転写産物が解析可能です。
Human Genome U133 Setを同じプローブセットデザインで完全にカバーしたうえで、さらに約6,500の遺伝子を追加しました。
この強力なプローブセットをツールとして利用すれば、１つの転写産物に対して複数の独立した測定が行えます。複数のプローブを用いることで、あらゆるマイクロアレイプラットフォームの中でも非常に高精度でしかも再現性の良い解析結果が得られます。
GeneChip® Systemは、豊富なデータと鋭い識見、さらに優れた解析評価能力を備えています。

アレイプロフィール

GeneChip Human Genome U133　Plus 2.0 Arrayには、旧製品GeneChip Human Genome U133 Setに搭載されていた全プローブセットが同様に搭載されています。これらのプローブセットは、GenBank®、dbEST、RefSeqから選択した配列に由来しています。配列クラスターは、UniGeneデータベース(Build 133, 2001年4月20日)をもとに作製されていますが、その他の入手可能な多数の公開されているデータベースとの比較や解析により、さらに精度が高められています。データベースとしては、ワシントン大学EST trace repository、カリフォルニア大学サンタクルーズ校Golden-Path ヒトゲノムデータベース(2001年4月公開)などが使用されています。

さらにこのアレイには、約6,500の新規遺伝子を解析可能な9,921個の新しいプローブセットが追加搭載されています。これらの遺伝子配列は、GenBank®、dbEST、RefSeqから選択しました。配列クラスターは、UniGeneデータベース(Build 159, 2003年1月25日)をもとに作製されておりますが、その他の入手可能な多数の公開されているデータベースとの比較や解析により、さらに精度が高められています。データベースとしては、ワシントン大学EST trace repositoryならびにNCBIヒトゲノムアセンブリ(Build 31)などが使用されています。

解析に必要なソフトウェア

*2003年9に出荷された、502で始まるシリアル番号のGeneChip® Scanner 3000は、すべて高解像度タイプのGCS3000です。501で始まるシリアル番号の旧バージョンスキャナーをお持ちの方は、HG-U133 Plus 2.0 Arrayを解析する際には、高解像度タイプへのアップデートが必要です。GCS3000スキャナーの高解像度タイプへのアップデートについては、弊社までお問合せください。また、GeneArray® 2500 Scannerをお持ちのお客様は、GCS3000へのアップグレードが必要となります。別途ご相談ください。

Data Sheets

Human Genome U133 Arrays (pdf, 1.76 MB)

Technical Notes

Design and Performance of the GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 and Human Genome U133A 2.0 Array (pdf, 207 KB)

GeneChip® Expression Platform: Comparison, Evolution, and Performance (pdf, 269 KB)

Application Notes

Microarray Applications in Infectious Disease (pdf, 252 KB)

Microarrays in Cancer Research (pdf, 423 KB)

Part #	Description	Includes
900470	GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array	Contains 2 arrays
900466	GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array	Contains 6 arrays
900467	GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array	Contains 30 arrays

Required Products

Part #	Description	Includes
00-0211	GeneChip Scanner 3000 7G with Workstation
	GeneChip® Operating Software	Includes the GeneChip Scanner 3000 High-Resolution Scanning Patch. See Product Page.
		* GeneChip Scanner 3000 High-Resolution Update is standard on all instruments shipped starting in September 2003 with serial number series 502. Previous versions, serial number series 501, will require the 00-0110 GeneChip Scanner 3000 High-Resolution Update to be installed.

Related Products

Part #	Description	Includes
	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Human Genome U133 2.0 Arrays

Manuals

3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 1.17 MB)

Alignment Data in PSL Format

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

HT 3' IVT Express Kit (pdf 8.41 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Array Comparisons

HG-U95 to HG-U133 Plus, Complex (zip, 37 MB)

Bovine to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 100 KB)

Bovine to HG-U133 Plus, Complex (zip, 598 KB)

Bovine to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 103 KB)

Bovine to HG-U133 Plus, No Match (zip, 27 KB)

Canine 2.0 to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 164 KB)

Canine 2.0 to HG-U133 Plus, Complex Match (zip, 1.4 MB)

Canine 2.0 to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 182 KB)

Canine 2.0 to HG-U133 Plus, No Match (zip, 32 KB)

Canine to HG-U133 Plus, All (zip, 433 KB)

Canine to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 19 KB)

Canine to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 20 KB)

Canine to HG-U133 Plus, No Match (zip, 30 KB)

HG-U133 Plus 2.0 to Rhesus Best Match

HG-U133 Plus 2.0 to Rhesus Complex

HG-U133 Plus 2.0 to Rhesus Good Match

HG-U133 Plus 2.0 to Rhesus No Match

HG-U133 Plus to Human Exon 1.0 ST, Best Match (zip, 899 KB)

HG-U133 Plus to Human Exon 1.0 ST, Complex Match (zip, 36 MB)

HG-U133 Plus to Human Exon 1.0 ST, Good Match (zip, 937 KB)

HG-U133 Plus to Human Exon 1.0 ST, No Match (zip, 1.5 KB)

HG-U133 Plus to Human Gene 1.0 ST, Best Match (zip, 651 KB)

HG-U133 Plus to Human Gene 1.0 ST, Complex Match (zip, 2.7 MB)

HG-U133 Plus to Human Gene 1.0 ST, Good Match (zip, 658 KB)

HG-U133 Plus to Human Gene 1.0 ST, No Match (zip, 38 KB)

HG-U133 to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 5 KB)

HG-U133 to HG-U133 Plus, Complex (zip, 24 MB)

HG-U133 to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 5 KB)

HG-U133 to HG-U133 Plus, No Match (zip, 1 KB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Best Match (zip, 1 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Complex Match (zip, 3.2 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, Good Match (zip, 1.3 MB)

HG-U219 to HG-U133_Plus_2, No Match (zip, 6 KB)

HG-U95 to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 35 KB)

HG-U95 to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 37 KB)

HG-U95 to HG-U133 Plus, No Match (zip, 1 KB)

Mouse 430 to HG-U133, Best Match (zip, 1 KB)

Mouse 430 to HG-U133, Complex (zip, 513 KB)

Mouse 430 to HG-U133, Good Match (zip, 1 KB)

Mouse 430 to HG-U133, No Match (zip, 111 KB)

Porcine to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 109 KB)

Porcine to HG-U133 Plus, Complex (zip, 596 KB)

Porcine to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 112 KB)

Porcine to HG-U133 Plus, No Match (zip, 28 KB)

Rat 230 to HG-U133 Plus, Best Match (zip, 1 KB)

Rat 230 to HG-U133 Plus, Complex (zip, 225 KB)

Rat 230 to HG-U133 Plus, Good Match (zip, 1 KB)

Rat 230 to HG-U133 Plus, No Match (zip, 79 KB)

Library Files

Human Genome U133 Plus 2.0 Array (zip, 30 MB)

Package Inserts

Human Genome U133 Plus 2.0 Array (pdf, 493 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

NetAffx Alignment Files

HG-U133_Plus_2 Alignments to Genome, PSL (7.4 MB, 9/28/06)

Current NetAffx Annotation Files

HG-U133_Plus_2 Annotations, CSV format, Release 32 (22 MB, 6/9/11)

HG-U133_Plus_2 Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (91 MB, 6/9/11)

HG-U133_Plus_2 BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (9.6 KB, 6/9/11)

HG-U133_Plus_2 Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (8.2 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.