GeneChip^® E. coli Genome 2.0 Array

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GeneChip® E. coli Genome 2.0 Arrayは大腸菌（E. coli）のK12株および大腸菌の 3種類の病原性株由来の転写産物を調べることができるプローブセットを含んでいます。新しいE. coli Genome 2.0 Arrayを利用すれば、K12株で進めている研究を続けながら、E. coliの3種類の病原性菌株も広範に調べることができます。

GeneChip® E. coli Genome 2.0 Arrayには、大腸菌の4種類の株に存在する全20,366遺伝子に対する、およそ10,000個のプローブセットが含まれています。大腸菌株間の高い類似性により、可能な場合には、単一のプローブセットがすべての4種類の株中の対応するオルソログを調べるようにタイリングされています。GeneChip E. coli Genome 2.0 Arrayは、大腸菌の全ORF（open reading frame）、700以上の遺伝子間領域に対するプローブセット、様々な抗生物質耐性マーカーに対するプローブ、前の世代のE. coliアレイのコントロールに加えて、追加コントロールとレポーター遺伝子を含んでいます。

Data Sheets

E. coli Genome 2.0 Array (pdf, 86 KB)

E. coli Genome 2.0 Array (pdf, 86 KB) - Japanese Version

Application Notes

Microarray Applications in Infectious Disease (pdf, 252 KB)

Part #	Description	Includes
900550	*GeneChip® E. Coli* Genome 2.0 Array**	Contains 2 arrays
900551	*GeneChip® E. Coli* Genome 2.0 Array**	Contains 6 arrays
900552	*GeneChip® E. Coli* Genome 2.0 Array**	Contains 30 arrays

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	Assays and Reagents	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Array Comparisons

Comparison Spreadsheets User's Guide (pdf, 82 KB)

E. coli Antisense Genome to E.coli Genome 2.0, Best Match (zip, 159 KB)

E. coli Antisense Genome to E.coli Genome 2.0, Complex (zip, 513 KB)

E. coli Antisense Genome to E.coli Genome 2.0, Good Match (zip, 102 KB)

E. coli Antisense Genome to E.coli Genome 2.0, No Match (zip, 15 KB)

Library Files

E.coli Genome 2.0 Array (zip, 7.5 MB)

Package Inserts

E.coli Genome 2.0 Array (pdf, 96 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

E_coli_2 Annotations, CSV format, Release 32 (2.5 MB, 6/9/11)

E_coli_2 Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (9.2 MB, 6/9/11)

E_coli_2 BLASTP annotations, CSV Format, Release 31 (5.1 KB, 8/11/10)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.