※ この製品は、2011年6月以降、在庫がなくなり次第、カタログ製品から受注生産品へ移行します。詳しくはこちらをご覧ください。
GeneChip® Drosophila Tiling 2.0R Array が発売になりました。この第二世代のアレイはBDGP release 5の配列を包括的に含みますが、ヘテロクロマチンの網羅はDrosophila Tiling 1.0R Arrayから特に改良された点です。
GeneChip® Drosophila Tiling 1.0R Array は、転写産物マッピングやChIP-on-chip研究などに使える、汎用性の高い全ゲノム研究用ツールです。
- 高密度な35塩基対のプローブ間隔により、新規RNA転写産物を高い精度で検出することができます。
- アフィメトリクス社の25-merプローブとPerfect Match/Mis-matchのプローブペアデザインにより、高い精度と特異性が確保されます。
- GeneChip® Drosophila Tiling 1.0R Arrayには、最新の遺伝子アノテーションを含むBerkeley Drosophila Genome Project Release 4.0からの、アップデートされた配列データが含まれています。
アレイプロフィール
GeneChip® Drosophila Tiling 1.0R Arrayは、アフィメトリクス社のMade-to-Order Programにより入手頂けます。このプログラムは、カスタムデザインのアレイと旧世代のGeneChip® カタログ製品を提供しています。これらのアレイは、公式のバリデーションテストを受けたものではありません。
本アレイは、第一世代のDrosophila 1.0R Tiling Arrayです。アフィメトリクス社の研究者がデザインしたこのアレイは、多数の論文に引用されています。また、Drosophila Tiling 1.0R Arrayには25-merのオリゴヌクレオチドプローブが使われ、1プローブの中心位置から隣接プローブの中心位置までが約35塩基対の間隔で、ショウジョウバエゲノム全体に均等に分布しています。RepeatMaskerソフトウェアにより、反復配列はこのデザインから除かれています。
次世代のDrosophila Tiling Arrayは、ヘテロクロマチン配列にさらに包括的に対応する予定です。
ご注意ください:Drosophila Tiling 1.0R Arrayから得られたデータは、今後発売されるGeneChip® Drosophila Tiling Arrayデザインと比較することはできません。
解析に必要な機器およびソフトウェア
GeneChip® Scanner 3000 7G
GeneChip® Operating Software (GCOS) version 1.0以上
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Archived Presentations
Scientific Forum, 1st European ChIP-on-chip
Webinar, Six-part ChIP-on-chip Symposia Series
Application Notes
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 900588 | GeneChip® Drosophila Tiling 1.0R Array | Contains 6 arrays |
Required Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 00-0211 | GeneChip® Scanner 3000 7G |
Related Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| Integrated Genome Browser (IGB) | Available Via Download | |
| Tiling Analysis Software (TAS) | Available Via Download | |
| 900301 | Control Oligo B2, 3nM | Sufficient for 30 samples |
| 900812 | GeneChip® WT Double-Stranded DNA Terminal Labeling Kit | Sufficient for 30 reactions |
Manuals
Chromatin Immunoprecipitation Assay Protocol (pdf, 679 KB)
Whole Transcript (WT) Double-Stranded Target Assay (pdf, 751 KB)
Sample Data
Tutorial
Library Files
Drosophila Tiling 1.0R Array (zip, 124 MB)
GeneChip Tiling Arrays - Data Analysis Library File Updates
Package Inserts
Drosophila Tiling 1.0R Array (pdf, 205 KB)


