DMET™ Plus Premier Pack



DMET™ Plus Premier Pack

薬物代謝研究のスタンダード化 

DMET™ Plus Premier Packは、 アレイ、試薬、専用解析ソフトウェアから構成され、薬物代謝研究のための既知の薬理遺伝学的マーカーを含むもっとも包括的で経済的な製品です。この製品は、薬物代謝研究を標準化し、従来法と比べ、薬物応答と関連する遺伝的変異のより迅速な見や測定を可能にします。

この製品パネルは、FDAによって評価されているすべての遺伝子マーカーに対応し、PharmaADMEグループによって定義されている現在のADME Coreマーカーの90％以上をカバーしています。この製品のコンテンツは、第一線の産学オピニオンリーダーとの協力のもと開発されました。

主な利点

  • ADME情報を標準化します
  • 生物学的に最も重要で高価値のデータを提供します
  • 能率的なワークフローで経済的です

主な特長

  • 225遺伝子上の1,936個の薬物代謝マーカーの解析が可能
  • FDAによって評価されているほとんどの遺伝子のマーカーを搭載
  • PharmaADMEグループによって定義されているADME Coreマーカーの90％以上をカバー
  • トランスレーションテーブルによってStar allele解析を自動化

DMET Plusは、 一般的なSNPや頻度の低いSNP、挿入、欠損、トリアレル、コピー数などのさまざまな遺伝的変異をカバーし、その多くは従来のSNP解析手法では検出できなかったものです。平均最小アレル頻度（MAF）が約20％のマーカーを調べる他のSNP検出法とは異なり、このパネルのADME Coreマーカーでは、より一般的な遺伝的変異も存在するものの、アレル頻度は9％未満です。

DMET Plus Premier Packでできること

  • 新しいバイオマーカー相関の発見
  • 薬物に対するレスポンダーかノンレスポンダーかの判断
  • 副作用リスクのある集団の特定
  • 薬物投与量の最適化
  • 薬物応答異常の解析
  • 臨床試験の被験者の選択的な募集
  • 既存の治療薬に対する新薬の差別化
  • 作用機序の研究

実証例

このパネルの高価値な独自のコンテンツによって、新しい重要なバイオマーカー相関を同定することが可能です。心臓発作や脳卒中を予防するために処方されるワルファリンは、薬物関連死を含む重篤な副作用を引き起こすことが知られている薬物の上位10位のうちの一つです。DMET Plusパネルを用いた最近のワルファリン研究では、薬物代謝酵素の一つであるCYP4F2の新しい変異体が発見され、これが選択された患者集団における投与量変動の8％を左右することがわかりました。（Caldwell, et al., Blood, 2008）。この新しいバイオマーカーについては、現在、前向き第III相試験が進行中です。この発見は、当社製品を用いた薬物代謝パネルに基づくアプローチにより実現した成果であり、今まで他の薬理遺伝学的方法では不可能でした。

迅速性

この製品は、1,936個の既知のADMEマーカーを同時に調べることができ、連続する複数の実験を行う必要がありません。また、DMET Console Softwareに含まれている翻訳テーブルは、SNPおよび非SNPのジェノタイピング結果を、標準化されたstar alleleの名称（CYP2D6*3、CYP2C19*2など）に自動翻訳しますので、データを既存のワークフローに統合することも簡単です。このプロセスは、数分で完了しますので、時間と費用を抑えることが可能です。

柔軟性

DMET Console Softwareは、マーカー内容に対応した使いやすいコントロールを備えており、臨床研究で報告される遺伝学的マーカーがインフォームドコンセントや他の治験審査委員会（IRB）の要件に沿って同意され、準拠していることを確認できます。また、このソフトウェアは、DMET Plusの各変異体に対して、あらかじめ設定され、かつ解析で検証したクラスタ境界を利用することで、単一サンプルの処理も可能です。すなわち、一度に解析できるサンプル数に下限がなく、各サンプルのジェノタイピング結果は完全に独立しています。この手法によって、サンプル解析の際に高い柔軟性が得られるだけでなく、個々のサンプル結果の完全性も維持されます。


お客様の声

「DMETパネルのおかげで、合併症のリスクのもっとも高い治療開始時にワルファリンを患者に処方する際に、安定した治療用量をより正確に確定できるようになりました。この研究を活用し、安定した治療用量をより正確に予測することで、ワルファリン治療の合併症を全体的に軽減できるものと期待しています」

--Michael Caldwell, M.D., Ph.D., Director, Wound Healing Program, Marshfield Clinic

「DMETパネルを使用することで、第II相臨床試験で前立腺癌の治療を行っている患者で化学療法薬ドセタキセルやサリドマイドの薬理遺伝学的特徴を明らかにすることができるようになり、このパネルを癌の臨床試験に容易に組み込めることが分かりました。DMETパネルの幅広さと奥深さは、薬物の代謝経路を通じて遺伝的変異の関連性を決定するユニークな手段をもたらします。われわれは、NCI60細胞株の特徴を解明することで、DMETパネルを利用した研究を続けようと考えています。この癌細胞株は、癌の分子生物学や化学療法に対する細胞応答を理解する目的で、世界中で使用されています。米国立癌研究所（NCI）は、この細胞株について100,000種類を超える抗癌剤候補の試験を行ってきました。DMETパネルを用いて、実際に数百種類の抗癌剤の薬理遺伝学の理解を深められるものと期待しています」

--John Deeken, M.D., Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University

関連資料

  • Mega, et al. Cytochrome p-450 polymorphisms and response to clopidogrel. NEJM 360(4): 354-362 (2009)
  • Daly, T. M., et al. Multiplex assay for comprehensive genotyping of genes involved in drug metabolism, excretion, and transport. Clinical Chemistry (2007). Pubmed
  • Caldwell, M. D., et al. CYP4F2 genetic variant alters required warfarin dose. Blood (2008). Pubmed
  • Dumaual, C., et al. Comprehensive assessment of metabolic enzyme and transporter genes using the Affymetrix® Targeted Genotyping System. Pharmacogenomics (2007). Pubmed
  • Deeken, J. F., et al. A pharmacogenetic study of docetaxel and thalidomide in patients with androgen-independent prostate cancer (AIPC) using targeted human DMET genotyping platform. Abstract #3580, ASCO Meeting (2007).
  • Frueh, F. W., et al. Pharmacogenomic Biomarker Information in Drug Labels Approved by the United States Food and Drug Administration: Prevalence of Related Drug Use. Pharmacotherapy (2008).
  • Robarge, J. D., et al. The Star-Allele Nomenclature: Retooling for Translational Genomics. Nature (2007).
  • Nebert, D. W. Polymorphisms in Drug-Metabolizing Enzymes: What Is Their Clinical Relevance and Why Do They Exist? American Journal of Human Genetics (1997).

 

研究用。診断目的には使用できません。

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Part # Description Includes
901268 DMET™ Plus Premier Pack The DMET Plus Premier Pack enables you to process 45 samples and three controls, and includes:

  • DMET™ Plus Arrays
  • DMET™ Plus Reagents
  • DMET™ Console Software

The DMET Plus Premier Pack is compatible with the GeneChip® Scanner 3000 7G System, GeneChip® Scanner 3000 7G Whole-Genome Association System, and GeneChip® Scanner 3000 Targeted Genotyping System.

Manuals

DMET™ Console Software User Guide (3.48 MB, 11/9)

DMET™ Plus Premier Pack User Guide (including protocol) (1.65 MB, 11/9)

DMET™ Plus Site Preparation Guide (132 KB, 11/9)

DMET™ Plus Starter Pack User Guide (including protocol) (1.75 MB, 11/9)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Quick Reference Cards

DMET™ Plus Premier Pack QRCs (546 KB, 11/9)

DMET™ Plus Starter Pack QRCs (488 KB, 11/9)

Material Safety Data Sheets

DMET™ Plus DNA Labelling Reagent (pdf, 78 KB)

DMET™ Plus Hybridization Solution (pdf, 93 KB)

DMET™ Plus Panel Kit (pdf, 86 KB)

DMET™ Plus Pre-Amp Kit (pdf, 92 KB)

DMET™ Plus Wash A Solution (pdf, 80 KB)

DMET™ Plus Wash B Solution (pdf, 80 KB)

Library Files

DMET™ Plus Genotyping Library Files (zip, 43MB)

DMET™ Plus Library Files (zip, 7.62 MB)

DMET™ Template for AGCC (zip, 145KB 3/10)

Package Inserts

DMET™ Plus Array (pdf, 73.7 KB)

DMET™ Plus Premier Pack Reagent Kit (58 KB, 11/9)

DMET™ Plus Starter Pack Reagent Kit (63 KB, 11/9)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

DMET_Plus Annotations, CSV format (233 KB, 12/4/09)

DMET_Plus Annotations, CSV format, Release 30 (122 KB, 3/26/10)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.

Archived NetAffx Annotation Files

DMET_Plus Annotations, CSV format, Release 29 (25 KB, 7/8/09)

Additional Support

DMET™ Plus Marker List (77 KB, 11/9)

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