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Affymetrix® Cytogenetics Research Solution

次世代のAffymetrix Cytogenetics Research Solutionには、表現型に影響を及ぼす広範な染色体異常を検出するためのアレイ、試薬、分析ソフトウェアが含まれています。高い解像度を持つアレイは、40万のSNPを含め、ゲノム全体をカバーする270万のマーカーを搭載しており、小さな領域の構造変化や同祖接合領域も検出することができます。キットは必要な試薬をほぼすべて含包しており、染色体異常を従来の方法に比べ容易に見つけることができます。細胞遺伝学研究用にデザインされたソフトウェアは、データの視覚化、カスタマイズ、ならびに分析のオプションを提供します。GeneChip® Instrument System と、次世代のAffymetrix Cytogenetics Research Solutionから細胞遺伝学の研究に必要な全てのものが手にいれられるでしょう。

偏りなくゲノム全体をカバーする最高の解像度

Affymetrix® Cytogenetics Whole-Genome 2.7M Array は、ゲノム全体を対象にして、最高の検出力で既知および新規の異常を見つけ出すことができます。偏りなくゲノム全体をカバーする、最高密度270万コピー数のマーカーによって、従来の検出技術では見のがされていた異常を含む微小な異常まで検出できるようになりました。アレイは、細胞遺伝学に特に関連の深いRefSeq遺伝子、癌遺伝子、miRNA領域、ならびにハプロ不全遺伝子を特に高密度にカバーしています。これに加えて、Whole-Genome 2.7M Arrayには、400,000種類もの一塩基多型（SNPs）も含まれており、ヘテロ接合性消失（LOH）、片親性ダイソミー（UPD）、ならびに同祖性接合のゲノム領域も検出できます。

アッセイの簡素化と効率化

Affymetrix® Cytogenetics Reagent Kitは、コピー数変異を正確に発見・同定できる、信頼性の高い簡便なアッセイです。PCRや制限酵素処理といったステップをなくし、操作時間は3時間以内と短く、これまで考えられなかったような短時間でDNAから結果を得ることができます。アッセイに必要なゲノムのDNA量は100ngと極めて微量であることから、羊水、血液、絨毛膜繊毛（CVS）、新鮮凍結組織、細胞株などの細胞遺伝学研究で用いられる幅広いサンプルに対応できます。さらにキットには必要な全ての試薬が収められているので、時間と費用を節約することもできます。

高い信頼性とフレキシビリティを備えた分析

当社の全く新しい Affymetrix® Chromosome Analysis Suite (ChAS) ソフトウェアは、細胞遺伝学研究用にデザインされたものであり、使いやすいグラフィックインターフェイスで細胞遺伝学研究で求められる的確な機能を含んでいます。このユニークなソフトウェアでは、次のことが可能です。

効率的な分析ワークフローによる結果の迅速な入手
ゲノム全体を対象とした染色体異常の概要の把握
意義が判明している特定領域に焦点をあてた分析
各種解像度でのゲノムの分析
的を絞った分析のための、独自のアノテーションおよび領域のカスタマイズとローディング
報告機能を備えた解釈プロセスの効率化
NCBI, UCSC Genome Browser, Ensembl,　やOMIMといった外部データベースへのダイレクトアクセス

完全な細胞遺伝学研究ソリューション

次世代のAffymetrix® Cytogenetics Research Solutionは、GeneChip® Instrument System とあわせてご使用いただく、細胞遺伝学研究のトータルソリューションです。

アフィメトリクスの細胞遺伝学への取り組み

アフィメトリクスは積極的に細胞遺伝学分野に取り組んでいます。アフィメトリクスは、最良の細胞遺伝学研究法確立を支援し、細胞遺伝学研究者との連携をはかり、共同研究を促進するためのコミュニティ Cytogenetics Research Community を設立しています。

本製品は試験研究用です。診断の目的には使用できません。

Affymetrix® Chromosome Analysis Suite (ChAS) ソフトウェアは、第一線の細胞遺伝学研究者の協力を得て開発されたソフトウェアで、細胞遺伝学分析に特化してデザインされています。このユニークなソフトウェアを利用すると、次のことが可能になります。

効率的な分析ワークフローによる結果の迅速な入手
ゲノム全体を対象とした染色体異常の概要の把握
意義が判明している特定領域に焦点をあてた分析
各種解像度でのゲノムの分析
的を絞った分析のための、独自のアノテーションおよび領域のカスタマイズとローディング
報告機能を備えた解釈プロセスの効率化
NCBI、UCSC Genome Browser、 Ensembl、 OMIMといった外部データベースへのダイレクトアクセス

GeneChip® Command Console® Software Plug-In for Cytogenetics Arrays

Command Console Software ワークステーションには、細胞遺伝学用アレイをスキャンするためのプラグインが必要です。cytogenetics.zip ファイルをCommand Console Softwareワークステーションにダウンロードしてzipアーカイブを解凍し、ReadMeファイルの指示に従ってインストールしてください。

Download the GeneChip® Command Console® Software Plug-In (zip, 59 MB）のダウンロード

Chromosome Analysis Suite (ChAS) Software

Chromosome Analysis Suite (ChAS) Softwareは、cytogenetics CELファイルについて様々なタイプの遺伝子分析を行います。1台または複数の分析用ワークステーションにインストールするには、ChromosomeAnalysisSuite.zipファイルをダウンロードして、zipアーカイブを解凍し、ReadMeファイルの指示に従ってインストールしてください。.

Download the Chromosome Analysis Suite (ChAS) Software (zip, 617 MB）のダウンロード

Zip ファイルの解凍方法

zipファイルを右クリックします
"Extract All（全解凍）"を選択します
ウィザードの指示に従います

あるいはWinZipなどのプログラムを使ってアーカイブを解凍してください。

本製品は試験研究用です。診断の目的には利用できません。

Data Sheets

Cytogenetics Research Solution (pdf, 268 KB)

Cytogenetics Research Solution (pdf, 624KB) - Japanese version

Manuals

Cytogenetics Assay Protocol (pdf, 2.13 MB)

Quick Reference Cards

Chromosome Analysis Suite (ChAS) Software: Single Sample Analysis (pdf, 242 KB)

Cytogenetics Assay (pdf, 352 KB)

Tutorial

Chromosome Analysis Suite (ChAS) Training Tutorial

Material Safety Data Sheets

Cytogenetics Research Solution (zip, 282 KB)

Product Updates

Critical Fluidics Station Maintenance (pdf, 137 KB)

Package Inserts

Cytogenetics Array (pdf, 68 KB)

Cytogenetics Reagent Kit (pdf 43 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

Cytogenetics_Array Annotations, CSV format, Release 30.1 (31 MB, 5/12/10)

Cytogenetics_Array Annotations, SQLite Format, Release 30.1 (245 MB, 3/8/10)

Cytogenetics_Array CN Annotations, CSV format, Release 30.1 (108 MB, 5/12/10)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.