GeneChip^® Citrus Genome Array

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GeneChip® Citrus Genome Array は、柑橘類（シトラス）の遺伝子発現をモニターするために特別にデザインされています。
このアレイは、Affymetrix GeneChip® Consortia Program の一環として、柑橘類の主要な研究者との共同研究により作製されました。アレイには、数種の柑橘類の種と交雑種に由来するEST配列を基にした33,879のシトラス転写産物に対する30,171プローブセットが含まれています。シトラスは世代が長く、生産に時間がかかるため、以下のように重要な遺伝学的メカニズムを特定するのに、このアレイは特に有用です。

高い収穫量
病気や害虫に対する耐性
環境的要因に対する成長反応

GeneChip® Citrus Genome Array は、シトラスにおけるこれらの複雑な遺伝学的性質を解明し、収穫を上げるための方法を決定するのに役立つツールです。このアレイには、シトラスの病原菌に対する46プローブセットと、様々なレポーター、選択マーカー、および導入遺伝子に対する60プローブセットが含まれています。また、シトラスの交雑種と一緒にPoncirus と Poncirus の交差種由来の配列も含まれています。

GeneChip® Citrus Genome Array は、Affymetrix GeneChip® Consortia Program の一環として、柑橘類の主要な研究者との共同研究により作製されました。

解析に必要な機器およびソフトウェア

高解像度スキャニング機能が搭載されたGeneChip® Scanner 3000　またはGeneChip Scanner®3000 7G*

高解像度スキャニング対応のGeneChip® Operating Software (GCOS) v1.1.1以上

* GeneArray®2500 Scannerをお持ちのお客様は、GCS3000へのアップグレードが必要となります。別途ご相談ください。

Data Sheets

Citrus Genome Array (pdf, 133 KB)

Part #	Description	Includes
900731	GeneChip® Citrus Genome Array	Contains 2 arrays
900732	GeneChip® Citrus Genome Array	Contains 6 arrays
900733	GeneChip® Citrus Genome Array	Contains 30 arrays

Related Products

Part #	Description	Includes
900375	GeneChip® T7-Oligo(dT) Promoter Primer Kit	Sufficient for 150 reactions
900431	GeneChip® One-Cycle cDNA Synthesis Kit	Sufficient for 30 reactions
900432	GeneChip® Two-Cycle cDNA Synthesis Kit	Sufficient for 30 two-cycle reactions
900371	GeneChip® Sample Cleanup Module (required)	Sufficient for 30 reactions
900449	GeneChip® IVT Labeling Kit	Sufficient for 30 reactions
900433	GeneChip® Poly-A RNA Control Kit	Sufficient for approximately 100 reactions
900454	GeneChip® Hybridization Control Kit (required)	See Product Page

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 895 KB)

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

HT 3' IVT Express Kit (pdf 8.41 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Library Files

Citrus Genome Array (zip, 20 MB)

Package Inserts

Citrus Genome Array (pdf, 494 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

Citrus Annotations, CSV format, Release 30 (2.0 MB, 11/15/09)

Citrus Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 30 (18 MB, 11/15/09)

Citrus BLASTP annotations, CSV Format, Release 30 (1.4 KB, 11/16/09)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.