GeneChip^® Chicken Genome Array

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GeneChip® Chicken Genome Arrayは、ニワトリのゲノムやニワトリ病原性ウイルスの研究に欠かせないツールです。

GeneChip Chicken Genome Arrayは、28,000以上のニワトリ遺伝子に対応した32,773種類の転写産物を広く網羅しています。また、このアレイには、17種類のトリウイルスに由来する684種類の転写産物を検出できる689のプローブセットも含まれています。
この強力なプローブセットをツールとして利用すれば、１つの転写産物に対して複数の独立した測定が行えます。複数のプローブを用いることで、あらゆるマイクロアレイプラットフォームの中でも非常に高精度でしかも再現性の良い解析結果が得られます。
GeneChip® Systemは、豊富なデータと鋭い識見、さらに優れた解析評価能力を備えています。

アレイプロフィール

GeneChip® Chicken Genome Arrayの配列情報を用いて、32,773種類のニワトリ転写産物と684種類のウイルス転写産物の遺伝子発現を調べることができます。対応する種は、ニワトリ（Gallus gallus）や17種類のトリウイルスなどです。アレイの配列情報は、GenBank®、UniGene（Build 18、2004年5月15日）、Ensembl（version 1、2004年5月公開）の公開データソースから選択されています。アレイのプローブセットは、11対のオリゴヌクレオチドでデザインされ、各転写産物を検出します。

解析に必要な機器およびソフトウェア

高解像度スキャニング機能が搭載されたGeneChip® Scanner 3000*

高解像度スキャニング対応のGeneChip® Operating Software (GCOS) v1.1.1以上

* GeneArray®2500 Scannerをお持ちのお客様は、GCS3000へのアップグレードが必要となります。別途ご相談ください。

Chicken Genome Arrayは、Affymetrix GeneChip® Consortia Programの一環としてデザインされました。

Data Sheets

Chicken Genome Array (pdf, 436 KB)

Chicken Genome Array (pdf, 84KB) - Japanese Version

Part #	Description	Includes
900590	GeneChip® Chicken Genome Array	Contains 2 arrays
900591	GeneChip® Chicken Genome Array	Contains 6 arrays
900592	GeneChip® Chicken Genome Array	Contains 30 arrays

Related Products

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900375	GeneChip® T7-Oligo(dT) Promoter Primer Kit	Sufficient for 150 reactions
900433	GeneChip® Poly-A RNA Control Kit	Sufficient for approximately 100 reactions
900454	GeneChip® Hybridization Control Kit (required)	See Product Page
900720	GeneChip® Hybridization, Wash, and Stain Kit	sufficient 30 reactions
	GeneChip® 3' IVT Express Kit

FAQs

Gene Expression Arrays

Manuals

3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 1.17 MB)

Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 1.70 MB)

HT 3' IVT Express Kit (pdf 8.41 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Library Files

Chicken Genome Array Array (zip, 20 MB)

Package Inserts

Chicken Genome Array (pdf, 492 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

NetAffx Alignment Files

Chicken Alignments To Genome, PSL Format (4.9 MB, 11/17/06)

Current NetAffx Annotation Files

Chicken Annotations, CSV format, Release 32 (6.7 MB, 6/9/11)

Chicken Annotations, MAGE-ML XML Format, Release 32 (53 MB, 6/9/11)

Chicken BLASTP annotations, CSV Format, Release 32 (664 B, 6/9/11)

Chicken Orthologs/Homologs, CSV Format, Release 32 (7.9 MB, 6/9/11)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.