Axiom® Genome-Wide Huma Array Platesは、集団最適化されたジェノタイピングパネルです。頻度の低い変異と高い変異について最高の遺伝的カバー率を実現しており、ゲノムワイドな疾患関連解析に最適です。
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マーカーを利用したウシ繁殖用のAxiom® Genome-Wide BOS 1 Array Plateに関する情報はこちら>
Axiom Genome-Wide Array Plates の特長:
各アレイは、各ターゲット集団について約90%のゲノムカバー率(r2>0.8)を達成するようにデザインされています。例えば以下のような領域にみられるMAF 1~5%のマーカーをカバーしています。
- 重要な生物学的カテゴリー(コーディングSNPなど)
- 生物学的プロセス(薬物代謝遺伝子など)
- 疾患カテゴリー(心血管疾患、がん、免疫、炎症、MHC、CNSなど)
- International HapMap Project、1000 Genomes Project、公開済みの疾患関連研究から得られた頻度の高い/低いSNP および 挿入/欠失(in/del)
- 生物学的および解析的に検証され、信頼のおける有益な結果を出すことが実証されているゲノムコンテンツ
- コーディングSNPなどの重要な生物学的カテゴリーと薬物代謝遺伝子や心血管系遺伝子などの生物学的経路をカバーするために事前に選択されたマーカー
- 高いサンプル合格率、コール率、再現性
- Axiom® 2.0 Reagent Kit、GeneTitan®MC 装置、自動または手動ワークフロー、Genotyping ConsoleTM Software との互換性
これらのアレイは、2つのカテゴリーに分類することができます。
仮説フリー型(Hypothesis-free):これらのアレイは、本来、全ゲノムカバー率を最大化するようにデザインされたもので、10kbの遺伝子の範囲内にあるSNPを含みます。
- Axiom® Genome-Wide CEU 1 Array Plate - 費用対効果が高く、ヨーロッパ人集団にみられる頻度の低い変異(MAF>1%)のカバー率を最大化する最初のアレイ
- Axiom® Genome-Wide ASI 1 Array Plate - 東アジア人(JPT および CHB)のゲノムの共通配列にみられる頻度の低いアレル(MAF>1%)のゲノムカバー率を最大化するようにデザインされた最初のアレイ
- Axiom® Genome-Wide CHB 1 Array Plate - 漢民族系中国人のゲノムにみられる頻度の高いアレル(MAF>5%)のゲノムカバー率を最大化する唯一のアレイ
- Axiom® Genome-Wide YRI Array Plate - ヨルバ族(西アフリカ人)のゲノムにみられる頻度の高い変異と低い変異(MAF>2%)の遺伝子カバー率90%以上を実現する最初のアレイ
近日発売
仮説ドリブン型(Hypothesis-driven)アレイプレート : これらのアレイは、集団最適化されフォーカスされたジェノタイピングパネルです。臨床上で使用可能な遺伝子をカバーするように最適化されています。これまでに実施されたゲノムワイド関連解析で同定され、よくみられる複雑な疾患または生物学的プロセスと強い関連がみられた特異的遺伝子座または遺伝子、あるいはその両方に関する研究を再現するために、頻度の低い変異(MAF 1~2%)について業界最高のカバー率を実現しています。
各仮説ドリブン型アレイは、特定集団にみられる臨床上で使用可能な遺伝子をカバーするよう最適化されています。
- Axiom Genome-Wide EUR Array - ヨーロッパ人系
- Axiom Genome-Wide EAS Array - 東アジア人系
- Axiom Genome-Wide AFR Array - 西アフリカ人系とヨーロッパ人系の統合集団
- Axiom Genome-Wide LAT Array - 先住アメリカ人系、ヨーロッパ人系、西アフリカ人系の統合集団
本製品は試験研究用ですので、診断の目的には使用できません。
Data Sheets
Axiom® Genome-Wide ASI Array Plate (pdf, 221 KB) -Japanese Version
DS Axiom Genotyping Solution - Japanese version
Publications
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| 901608 | Axiom™ Genome-Wide CEU 1 Array Plate | Includes one 96-array Axiom Genome-Wide CEU 1 Plate |
| 901640 | Axiom™ Genome-Wide ASI 1 Array Plate | Includes one 96-array Axiom Genome-Wide ASI 1 Plate |
| 901764 | Axiom™ Genome-Wide CHB 1 Array Plate | Includes one 96-array Axiom Genome-Wide CHB 1 Plate |
| 901758 | Axiom™ 2.0 Reagent Kit | Includes all reagents (except isopropanol) to process 96 reactions |
| 901606 | Axiom™ GeneTitan® Consumables Kit | Contains all GeneTitan® consumables required to process one Axiom array plate |
Required Products
| Part # | Description | Includes |
|---|---|---|
| GeneChip Command Console Software (AGCC) | ||
| GeneTitan family of instruments |
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