GeneChip® Human Mapping 100K Set

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Human Mapping 100K Set

※この製品は2010年12月22日をもって販売終了となりました。

GeneChip® Human Mapping 100K Set は、ますます充実するコピー数解析製品ラインナップのひとつです。この製品は、実績があり使いやすいGeneChip® Mapping Assayを用いて、最高レベルの分解能でのコピー数解析が可能な2枚のアレイセットで構成されています。26kbの平均マーカー間距離により、ゲノムカバー領域は最大となり、染色体コピー数変化の検出力も向上します。本製品は、コピー数とアリル特異的な情報の両方を提供できる唯一のテクノロジーで、コピーニュートラルな変化の発見を可能にします。



View coverage of 100,000 SNPs
100,000 SNPs

GeneChip® Mapping 100K Setは、集団遺伝学、連鎖不均衡解析、全ゲノムアソシエーションスタディなどの他のアプリケーションにも利用されてきました。新しいGeneChip® Mapping 500K Array Setは、遺伝的個人差を解析できる能力がより高く、これらのアプリケーションに推奨される製品です。

特長

  • 1回の実験でコピー数とアリル特異的な情報が得られます。
  • 最高レベルの分解能でのコピー数解析が行えます。
  • コピー数、ジェノタイプ、発現データを、ゲノムやゲノムアノテーションとの関連で視覚化できます。
    • Integrated Genome Browserの詳細は、こちらをご参照ください。
  • 実績のあるコピー数解析法です。
    • 50報を超えるマッピングアッセイに関する原著論文の一覧は、こちらをご覧ください。
  • 公開されている解析ソリューションはますます増えています。
    • コピー数に関する解析ソリューションの詳細は、こちらをご参照ください。

解析に必要な機器およびソフトウェア


詳細については、データシート(日本語pdf, 679KB)をご覧ください。

現在、この製品に関する資料はございません。詳細については、supportjapan@affymetrix.comまでお問合せください。

Part # Description Includes
900518 GeneChip® Human Mapping 50K Array Xba 240 Contains 30 Mapping 50K Xba Arrays
900523 GeneChip® Human Mapping 50K Array Hind 240 Contains 30 Mapping 50K Hind Arrays
900520 GeneChip® Mapping 50K Xba Assay Kit Sufficient for 30 reactions
900521 GeneChip® Mapping 50K Hind Assay Kit Sufficient for 30 reactions
900807 GeneChip® Human Mapping 50K Xba Adaptor Sufficient for 30 reactions
900808 GeneChip® Human Mapping 50K Hind Adaptor Sufficient for 30 reactions
900534 PCR Primer 001 Sufficient for 100 PCR reactions

Required Products

Part # Description Includes
Affymetrix® GeneChip® Command Console® Software Available Via Download
Affymetrix® Genotyping Console™ Software Available Via Download
00-0079 GeneChip® Fluidics Station 400 or Fluidics Station 450/250
800138 GeneChip® Hybridization Oven
00-0186 GeneChip® Scanner 3000 with high-resolution scanning patch

Related Products

Part # Description Includes
901153 Genome-Wide Human SNP Array 6.0

FAQs

Human Mapping 100K Set

Manuals

100K Mapping Assay Manual (pdf, 1.2 MB)

Probe Set Data in MAGE-ML Format

Sample Data

Mapping 100k HapMap Trio Dataset

Material Safety Data Sheets

Mapping 100K Array Set, Hind Array (zip, 288 KB)

Mapping 100K Array Set, Xba Array (zip, 288 KB)

Library Files

Mapping 50K Hind 240 Array (zip, 16 MB)

Mapping 50K Xba 240 Array (zip, 17 MB)

Package Inserts

Human Mapping 50K Array Xba 240 and Human Mapping 50K Array Hind 240 (pdf, 71 KB)

Human Mapping 50K Xba Assay kit and Human Mapping 50K Hind Assay Kit (pdf, 43 KB)

Alignment, Annotation, and Sequence Files

Information about using Alignment, Annotation, and Sequence files

Current NetAffx Annotation Files

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 32 (11 MB, 7/15/11)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 32 (12 MB, 7/15/11)

Mapping50K_Hind240 Annotations, GDAS3, Release 20 (15 MB, 6/27/05)

Mapping50K_Xba240 Annotations, GDAS3, Release 20 (16 MB, 6/27/05)

Mapping50K_Hind240 Annotations, GTYPE Format, Release 21 (12 MB, 1/2/07)

Mapping50K_Xba240 Annotations, GTYPE Format, Release 21 (13 MB, 1/2/07)

Mapping50K_Xba240,Mapping50K_Hind240 Annotations, SQLite Format, Release 32 (33 MB, 6/24/11)

Mapping50K_Hind240 GC Content Data, NCBI Build 36, TSV Format, Release 21 (806 KB, 1/2/07)

Mapping50K_Xba240 GC Content Data, NCBI Build 36, TSV Format, Release 21 (895 KB, 1/2/07)

Note: NetAffx annotation files are intended for use in automated analysis. Some are not compatible with all spreadsheet applications. Please use the NetAffx Analysis Center to limit download data to your probe sets of interest. Annotation CSV files for the exon arrays are split into a probe set-level annotation file and a transcript cluster-level annotation file; exon array CSV files are compatible with ExACT.

Sequence Files

Mapping50K_Hind240 Flanking Sequences, FASTA (1.2 MB, 8/20/08)

Mapping50K_Xba240 Flanking Sequences, FASTA (1.3 MB, 8/20/08)

Mapping50K_Hind240 Probe Sequences, Tabular (11 MB, 8/20/08)

Mapping50K_Xba240 Probe Sequences, Tabular (12 MB, 8/20/08)

Archived NetAffx Annotation Files

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 21 (10 MB, 1/29/07)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 21 (11 MB, 1/29/07)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 22 (11 MB, 3/9/07)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 22 (11 MB, 3/9/07)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 23 (11 MB, 7/12/07)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 23 (12 MB, 7/12/07)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 24 (10 MB, 11/28/07)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 24 (11 MB, 11/28/07)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 25 (12 MB, 3/19/08)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 25 (12 MB, 3/19/08)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 26 (12 MB, 7/9/08)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 26 (12 MB, 7/9/08)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 27 (11 MB, 11/25/08)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 27 (11 MB, 11/25/08)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 28 (11 MB, 3/6/09)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 28 (12 MB, 3/6/09)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 29 (9.9 MB, 7/8/09)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 29 (10 MB, 7/8/09)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 30 (11 MB, 11/15/09)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 30 (11 MB, 11/15/09)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV format, Release 31 (11 MB, 8/30/10)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV format, Release 31 (11 MB, 8/30/10)

Mapping50K_Hind240 Annotations, CSV, Release 20 (10 MB, 6/15/06)

Mapping50K_Xba240 Annotations, CSV, Release 20 (10 MB, 6/15/06)

Mapping50K_Hind240 Annotations, GTYPE, Release 20 (11 MB, 3/9/06)

Mapping50K_Xba240 Annotations, GTYPE, Release 20 (11 MB, 3/9/06)

Mapping50K_Xba240,Mapping50K_Hind240 Annotations, SQLite Format, Release 24 (29 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Hind240,Mapping50K_Xba240 Annotations, SQLite Format, Release 25 (33 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Hind240,Mapping50K_Xba240 Annotations, SQLite Format, Release 26 (33 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Hind240,Mapping50K_Xba240 Annotations, SQLite Format, Release 27 (31 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Hind240,Mapping50K_Xba240 Annotations, SQLite Format, Release 28 (31 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Hind240,Mapping50K_Xba240 Annotations, SQLite Format, Release 29 (27 MB, 10/13/09)

Mapping50K_Xba240,Mapping50K_Hind240 Annotations, SQLite Format, Release 30 (30 MB, 11/15/09)

Mapping50K_Xba240,Mapping50K_Hind240 Annotations, SQLite Format, Release 31 (31 MB, 8/30/10)

Additional Support

Fluidics Scripts

Mapping 50K Hind Reference DNA Concordance (zip, 3.5 MB)

Mapping 50K Hind Reference Genotype Calls (zip, 152 KB)

Mapping 50K Xba Reference DNA Concordance (zip, 3.5 MB)

Mapping 50K Xba Reference Genotype Calls (zip, 157 KB)

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