GeneChip® Rat ToxFX 1.0 Array は、直接的に毒物学の対象となる55のシグネチャーと22のパスウェイに対応する、2,073のプローブセットを含む1枚のアレイで構成されています。マイクロアレイデータの解析は、ToxFX Study Builder ソフトウェアとToxFX Analysis Engine によって完全に自動化されており、医薬品候補化合物や対象化合物の毒物学的・薬理学的特性を網羅的かつ読みやすいレポートにまとめることが可能です。

Rat ToxFX 1.0 Array

Rat ToxFX 1.0 Arrayは、全ゲノムRat Genome 230 2.0 Arrayに搭載されている内容から選ばれたサブセットで構成されます。このサブセットのプローブセットは、Drug Signature®と関連する遺伝子とIconix BioscienceのDrugMatrix®ライブラリに掲載されているパスウェイに対応します。

Rat ToxFX 1.0 Arrayの全プローブセットは、Rat Genome 230 2.0 Arrayの対応部分と同一です。このサブセットアレイには、同じハイブリダイゼーション、サンプル標識、ハウスキーピングのコントロールが含まれます。特徴全体の比較については、データシートの図3と表1をご覧ください。

Rat ToxFX 1.0 Arrayが調べる各遺伝子配列転写レベルを11対のオリゴヌクレオチドプローブを使って測定します。オリゴヌクレオチドプローブは、アフィメトリクスのフォトリソグラフィー工程を用いて、GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Arrayと全く同じ製造工程でin situ合成されます。

ToxFX Report

ToxFX ReportはPDF形式で自動的に生成され、毒物学研究とその結果について、あらゆる側面の詳細なサマリーを提供します。データはさまざまなレベルで要約され、要旨から詳細なパスウェイ解析までが作成されます。

レポートに含まれるセクション：

• 要旨（Executive Summary）－重要な安全性項目を中心とする、1ページのサマリー
• 研究の詳細（Study Description）－研究デザインの詳細な記録
• 薬剤シグネチャー（Drug Signatures）－50以上の生物学的結果（胆汁うっ滞、胆管過形成など）との毒物学的一致に基づいた、可能性のある安全性の問題に関するレポート
• パスウェイ（Pathways）－毒物に関連する22の重要な分子パスウェイ（胆汁酸、コレステロール代謝や酸化ストレスなど）に対する治療効果を示す、詳細な解析とダイアグラム
• 毒物学関連遺伝子の分類（Toxicologically Relevant GeneGroupings）－毒物学に関連のある注目すべき遺伝子（チトクロムP450など）の発現データで構成される一つの表
• 方法と用語集（Methodology and Glossary）－結果の解釈に必要な解析方法と用語の説明

解析に必要な試薬

• GeneChip One-Cycle Target Labeling and Controls Kit

解析に必要な機器

解析に必要なソフトウェア

• GeneChip® Operating Software v1.4 or higher
• Affymetrix® Expression Console™ Software
• ToxFX™ Study Builder

GeneChip® expression arrays全製品の個々のプローブセットについては、Array Finder をご参照ください。

詳細についてはdata sheet (英語pdf, 234KB)をご参照ください。