ホーム ログイン ご登録 会員プロフィール お問合せ
   
アフィメトリクス
製品 サポート 解析 Scientific Community 会社概要                  US本社 
アプリケーション
研究領域
DNA
全ゲノム
標的ジェノタイピング
塩基配列解析
発現解析
発現定量
    遺伝子制御
トキシコゲノミクス
臨床
研究と試験
Molecular Diagnostics
研究分野
製品
GeneChipシステム
GeneChipアレイ
アッセイと試薬
解析システム
ソフトウェア
NetAffxTM Analysis Center
テクノロジー
概要
アレイの作製
コンビナトリアルケミストリー
プローブのデザインと選択
分子反転プローブ
ミスマッチ修復検出
アフィメトリクスプログラム
Consortia-Designed Array
GeneChip互換ソフトウェア
GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Array 

GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Arrayは、トキシコロジー、神経生物学やその他、ラットをモデル生物として使用するアプリケーションの強力なツールとなります。

1枚のアレイで、ラットゲノム転写産物を幅広くカバー
約28,000個の特徴が明らかなラット遺伝子由来の、約30,000個の転写産物およびバリアントの発現レベルを31,000のプローブセットで解析
塩基配列の精度を高め、得られるデータをより高品質にするため、公開されているラットゲノムのドラフト配列とラットの公開データベースを使用
・  高性能のバイオインフォマティクス・ツールであるNetAffxTM Analysis Centerにアクセスすれば生物学的に意義のある結果を即座に入手可能

アレイ・プロフィール

GeneChip Rat Genome 230 2.0 Arrayには、GeneChip Rat Expression Set 230に搭載されている全プローブセットが含まれています。GeneChip Rat Genome 230 2.0 Arrayのデザインに使用された塩基配列は、GenBank®、dbEST、RefSeqから選択した配列に由来しています。配列クラスターは、UniGeneデータベース(Build 99、2002年6月)から作製し、公開されているBaylor College of Medicine Human Genome Sequencing Centerのラットゲノムのドラフト配列(2002年6月)との解析や比較を経て改良されています。

GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array には、GeneChip Rat Genome U34 Set に搭載されていた塩基配列とESTクラスターに関連した、RefSeqデータベースの塩基配列およびプローブセットが含まれています。

各対応配列に相補的なオリゴヌクレオチドプローブは、in situでアレイ上に合成しています。11対のオリゴヌクレオチドプローブを用いて、GeneChip® Rat Genome 230 2.0 Array上の各配列に対応する転写レベルを測定します。

解析に必要な機器およびソフトウェア

高解像度スキャニング機能*が搭載されたGeneChip Scanner 3000
高解像度スキャニング対応のGeneChip Operating Software (GCOS) v1.1.1

*2003年9月以降に出荷された、502で始まるシリアル番号のGeneChip®Scanner3000は、すべて高解像度タイプのGCS3000です。501で始まるシリアル番号の旧バージョンスキャナーをお持ちの方は、Rat Genome 230 2.0 Arrayを解析する際には、高解像度タイプへのアップデートが必要です。GCS3000スキャナーの高解像度タイプへのアップデートについては、弊社までお問合せください。また、GeneArray® 2500 Scannerをお持ちのお客様は、GCS3000へのアップグレードが必要となります。別途ご相談ください。

GeneChip® expression arrays全製品の個々のプローブセットについては、Array Finder をご参照ください。

詳細についてはdata sheet (日本語pdf, 451KB, 英語pdf, 106KB)をご参照ください。

ご注文情報

900505 Rat Genome 230 2.0 Array
アレイ2枚入り
900506 Rat Genome 230 2.0 Array
アレイ6枚入り
900507 Rat Genome 230 2.0 Array
アレイ30枚入り
 
ご注文に際しては、アフィメトリクス・ジャパン(株)までお問合せください。
 
関連製品
試薬
SUPPORT
Gene Expression Arrays
Rat Genome 230 2.0 Array
Rat Genome 230 2.0 Array (zip, 17 MB)
3' IVT Express Kit User Manual (pdf, 3.47 MB)
Alignment Data in PSL Format
Expression Analysis Technical Manual, with Specific Protocols for Use with the Hybridization, Wash, and Stain Kit (pdf, 2.1 MB)
Probe Set Data in MAGE-ML Format
Rat Genome 230 2.0 Array Normalization Controls (zip, 1 KB)
Rat Genome 230 2.0 Array (pdf, 243 KB)
ADDITIONAL SUPPORT
Fluidics Scripts
Probe Set Data in Tabular Format
Technical Notes
All Support Materials for Rat Genome 230 2.0 Array
03-5730-8200(代表) Copyright(C)2006 Affymetrix Japan K.K. All Rights Reserved ご利用条件 プライバシーポリシー