| |
 Back to Mouse Gene 1.0 ST Array Main Page
GeneChip® Mouse Gene 1.0 ST
Arrayは、特徴が明らかな遺伝子について、ゲノム全体の遺伝子レベルの発現解析を可能にします。28,000以上の遺伝子レベルのプローブセットから構成され、75万以上の25-merオリゴヌクレオチドプローブセルから成る、1枚のGeneChip®ブランドのアレイです。
Mouse Gene 1.0 のデザインは、主に、既知遺伝子の十分な証拠を持つエクソンにマッピングすることができる、GeneChip® Mouse Exon 1.0 ST Array プローブのサブセットに基づいています。そのため Expressed Sequence Tag（EST）や、RefSeq XMに基づく新規発見のためのコンテンツは、Mouse
Gene 1.0 ST Arrayでは調べることができません。しかし、予測されるEnsembl EnsGene転写産物は、他のEnsGeneコンテンツとともに含まれています。
このアレイのデザインは、以下のデータベースから得られた配列と遺伝子アノテーションに基づいており、プローブを遺伝子レベルのプローブセットにまとめるのに用いられます。これら配列は、Mouse
Exon 1.0 ST Array上には存在しない新しい追加プローブを選択するのに利用されている場合もあります。
| |
・ |
2006年2月公開のマウスゲノム配列（UCSC
mm8, NCBI build 36） |
 |
|
|
|
| |
・ |
RefSeq NM（curated
とprovisionalでpredictedの配列は含まない）mRNA配列（19,719個の配列）。2007年4月3日現在 |
|
|
|
|
| |
・ |
GenBank®のタンパク質をコードする完全長mRNA（353,257個の配列）。2006年11月13日現在 |
|
|
|
|
|
・ |
マウスEnsembl転写産物。2007年4月3日現在（35,882個の転写産物） |
|
|
|
|
|
・ |
ヒト（68,820個の配列）およびラット（20,409個の配列）からのシンテニー・マッピングされた完全長RNAとRefSeq NM |
|