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最適なアレイ性能を引き出すための試薬、ソフトウェアおよび装置の完成されたソリューション
Gene 1.0 ST Array
は、簡便性と完全なサポートのために、アフィメトリクス社の試薬および装置を含む統合されたソリューションの一部として提供されます:
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GeneChip® WT Sense Target Labeling
and Control Reagents.アッセイの手順および性能に関する詳しい情報については、
WT
Sense Target Labeling Assay Manual をご参照ください。 |
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最高レベルの再現性を実現し、手間のかからないアレイ処理を可能とするGeneChip® Fluidics Station 450 |
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オプションのAutoLoaderを備えたアレイイメージ取得用のGeneChip®
Scanner 3000 7G |
アフィメトリクス社ではExpression
ConsoleTM ソフトウェアやNetAffxTMAnalysis
Center, Integrated
Genome Browser など、皆様のデータ解析を助けるツールを提供しています。
Expression Console
ソフトウェアは、プローブセットのデータ解析や予備的なデータの品質評価を可能にする使いやすいアプリケーションです。シンプルなワークフローは、迅速なデータの解析を可能とします。(図を参照)。結果として得られたデータは、Affymetrix.
GeneChip®-compatible
ソフトウェアプロバイダー製のソフトウェアアプリケーションを用いて、さらなる解析も可能です。これらのアプリケーションの詳細なリストについては、こちらをご覧ください。
NetAffx Analysis
Centerは、プローブセットの生物学的および機能的なアノテーションを備えており、これらは定期的に更新されます。アレイアノテーションとプローブの配列情報のきわめて包括的なデータソースです。応用範囲の広い検索ツールと外部へのリンクは、研究者の皆様が関心をお持ちの遺伝子とアノテーションを掘り下げて調べることを可能とします。このリソースによって、アレイ実験の結果解釈と、それに続く研究の迅速なデザインが容易になります。
また、IGBを利用することで、ゲノム構造の中で結果を視覚化することが可能です。マイクロアレイの遺伝子発現シグナルデータと併せて、RefSeq配列やさまざまなソースからのSNPや遺伝子の位置情報を含むゲノムアノテーションを見ることができます。

Gene 1.0 ST Arrayのデータ解析ワークフローは、3'遺伝子発現解析と類似していて、Expression
Console 1.1、他社のGeneChip®-compatible ソフトウェア、NetAffx
Analysis CenterやIGBなどのアノテーションツールが利用できます。 |