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アフィメトリクス
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GeneChip互換ソフトウェア
GeneChip® Human Exon 1.0 ST Array - デザインのサマリー
 

プローブセット

140万
エクソンクラスター 100万以上
推定される完全長mRNAによるサポート 289,961 プローブセット
Ensembl転写産物によるサポート 306,583 プローブセット
ESTによるサポート 665,175 プローブセット
マウスまたはラットmRNAによるサポート 220,262 プローブセット
遺伝子予測によるサポート 883,105 プローブセット
プローブ選択領域 転写産物の全長
プローブ/プローブ選択領域 41
バックグラウンド補正方法 同じGC含量をもつ1,000のバックグラウンドプローブの中央値強度
1アレイあたりのプローブセル総数 5,500,000以上
ターゲットの方向性 センス鎖2

1プローブ選択領域の長さと配列上の制約のため、約10パーセントのエクソンプローブセットではプローブが4未満となっています。
2アレイ上にタイリングされているプローブはアンチセンスの方向でデザインされているため、センス鎖標識ターゲットをアレイにハイブリダイズさせる必要があります。本アレイはセンスターゲットを用いる必要性(標識サンプルがアレイにハイブリダイズされる)から、STアレイと呼ばれています。.

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