GeneChip® Drosophila Tiling 2.0R Array は、アフィメトリクスの第二世代のショウジョウバエタイリングアレイです。本アレイは、新しい転写領域のマッピングやクロマチンIP結果のゲノムワイドな解釈などに使える、汎用性の高い全ゲノム研究用ツールです。

本アレイは、前世代アレイのデータに基づいていますが、そのほかにBerkeley Drosophila Genome Project（BDGP）によってその後提供された追加配列も含まれています。新しい配列の多くは、ショウジョウバエゲノムのヘテロクロマチン領域に存在する配列です。

アレイプロフィール

・　最新の配列データ

• BDGP genome release 5 に基づいています。
• release 5 の修正では、数百個の既知・予想遺伝子を含むヘテロクロマチン領域に対応しています。

・　新しいデザイン戦略により、ゲノムを完全に網羅しています。

• 反復領域が含まれています。
• チップのデザインに反復マスキングを使用していません。
• 新しいタイリングアレイデザインです（アフィメトリクスのWhite Paper、Drosophila Tiling 2.0R Array Design and Library files ）をご覧ください）。
• 25-merのオリゴヌクレオチドプローブが、平均38塩基対の間隔でゲノム全体にタイリングされています。

・　フレキシブルな解析オプション

• 標準解析ライブラリファイル（bpmapファイル）は、FryBase 5.2とUCSC Genome Browser の反復アノテーションの定義に従って、反復領域を除外します。
• カスタマーサポートを通じてリクエストいただければ、全アレイデータ解析ライブラリファイルをご提供します。

ご注意ください：アレイのコンテンツやデザイン戦略、解析ライブラリファイルコンテンツが異なるため、Drosophila Tiling 1.0R ArrayとDrosophila Tiling 2.0R Arrayの結果を直接比較することは推奨できません。

解析に必要な機器およびソフトウェア

• GeneChip Scanner 3000 7G
• GeneChip Operating Software（GCOS）version 1.0 以上