最高レベルの遺伝学的解析力と最小の費用で、研究を計画しましょう。研究でジェノタイピングするサンプル数は、全ゲノムスキャンの解析能を高める唯一にして最も重要な要因です。アフィメトリクスの500K Mapping Array Setは、1サンプル当たりのジェノタイピング費用を削減することで、1回の研究で解析できるサンプル数を大幅に増加でき、真のアソシエーションを検出できることにより高い遺伝学的解析力をもたらします。

GeneChip® Human Mapping 500K Array Setは、さまざまな集団において、一貫して高いカバー率を提供します。セットは2枚のアレイで構成され、各アレイは平均250,000のSNPをジェノタイピングできます（Nspアレイでは約262,000、Styアレイでは約238,000）。このセットは、3年たらずの間に120報以上の論文発表により実証されているGeneChip® Mapping 10K ArrayとGeneChip® Mapping 100K Set と同じ、確立されたアッセイを使用しています。

アフィメトリクスは、初期の発見から、くり返し実験とファインマッピング、塩基配列解析、対立遺伝子の機能テストに至るまで、典型的な全ゲノムアソシエーションスタディの各段階に応じて、ソリューションをご提供します。アフィメトリクスは、2007年第1四半期に、100万SNPの製品を投入いたします。また、2006年末までには、スループットを増やし、より大規模な実験を実施できる500Kセットを、1枚のアレイとしてご提供する予定です。

2006年5月にMapping 500K の一連のアップデートが行われました。

• 新しいジェノタイプコーリングアルゴリズムBRLMMを採用しました。これまでのMapping 500K Array Setのデータを再解析し、コールレートと精度を向上させることができます。
• より迅速でより安定した96-ウェルプレート用プロトコールにより、大量サンプル処理が可能です。

Mapping 500K Array Setの特徴

• 異なる集団を広くカバー
  カバーしているゲノム領域についてはこちら をご覧ください。
  全ゲノムアソシエーションスタディに関してはこちら をご覧ください。
• 全ゲノムアソシエーションスタディの参照データの利用
  研究者グループによって1万以上のコントロールサンプルについてのデータベースが作成されており、Mapping　500K　Array Set　のデータを公開するコンソーシアムが計画されています。
• 遺伝子を発見する実証済みのアプローチ
  Mapping アッセイに関する80以上の原著論文がございます。リストはこちらをご覧ください。
  96ウェルプレート用のプロトコールを含む新しい実験マニュアルはこちらをご覧ください。
• さまざまなDNAサンプル調製法との幅広い適合性
  250ngのゲノムDNA
  全ゲノム増幅したDNAにも適合
• 最高水準のスループット
  一台のシステムで1週間に100のサンプルを処理できます。
  AutoLoader付きのGeneChip®Scanner 3000についてはこちらをご覧ください。
• データ解析と管理の画期的なソリューション
  新しいジェノタイプコーリングアルゴリズム(BRLMM)についてはこちらをご覧ください。
  GeneChip Genotyping Analysis　Software（GTYPE）による自動ジェノタイプコールとデータ管理についてはこちらをご覧ください。
  さらなる解析のための、GeneChip-Compatibleな他社製のソフトウェアについてはこちらをご覧ください。

Whole Genome Sampling Assay で用いるクロンテック社のTitanium^TM DNA Amplification Kitの詳細はこちらをご覧ください。

解析に必要な機器およびソフトウェア

• GeneChip® Operating Software (GCOS)
• GeneChip® Genotyping Analysis Software (GTYPE)
• GeneChip® Fluidics Station 450
• GeneChip® Hybridization Oven 640
• GeneChip® Scanner 3000 7G

GeneChip® 500K Array Set の製品情報はこちら（日本語pdf, 2.65MB)をご覧ください。