2007年7月から全てのWT Sense Target Labeling
Assayのプロトコルが変わりました。試薬自体に変更はありません。
我々の生物学の理解は急速に進歩しており、これまでの1遺伝子1蛋白質、そして単一の機能という従来のパラダイムは単純すぎたことが明らかになっています。
ヒト遺伝子の60%以上が選択的スプライシングを受けており、異なる機能をもちうる何十万種類もの転写産物バリアントが生成されます。また、疾患の原因となる点突然変異の50%もがスプライシングに影響を及ぼしています。多くのRNA転写物はポリAテールさえ含んでおらず、既知の遺伝子の多くは変化しうる5'および3'末端を有しています。
そのため、次のような疑問が生じます。古典的な3'ベースのマイクロアレイによる発現プロファイリング実験は、全体像を捉えているのでしょうか。また、これらのゲノム現象は、答えを出そうとしている生物学上の疑問に対して、どのような影響を及ぼすのでしょうか。
以上の理由により、アフィメトリクス社は、3'末端だけでなく遺伝子の全長について調べることを可能にする一連の製品を開発しました。アフィメトリクス社の高密度アレイとGeneChip® Whole Transcript Assayの組み合わせは、より完全かつ正確な遺伝子発現の全体像をもたらし、発現のレベルだけでなく、正確に何が発現されているかも実験により検出することを可能とします。
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